Temas 6-15 Parcial 2 (10 Temas)
Temas 6-15 Parcial 2 (10 Temas)
Temas 6-15 Parcial 2 (10 Temas)
2 PARCIAL (T 6,7,8,9,10,11,12,13,14,15)
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ÍNDICE - 2º PARCIAL
6. INTRODUCCIÓN AL METABOLISMO
2
TEMA 6. INTRODUCCIÓN AL METABOLISMO
Desde el punto de vista energético, toda reacción sucede siempre con un descenso de
energía en las moléculas: los sustratos nunca pueden ser más pobres en energía que los
productos
Las reacciones EXERGÓNICAS espontáneas se acoplan a reacciones ENDERGÓNICAS
para que éstas ocurran → De ese modo, el conjunto es exergónico y factible
SÍNTESIS DE ATP
• FOSFORILACIÓN A NIVEL DE SUSTRATO: transformo ADP en ATP gracias a la
transferencia de un fosfato con su energía, desde una molécula con alta energía interna
• FOSFORILACIÓN OXIDATIVA: reoxidación de los nucleótidos. Se utiliza la energía
generada por el paso de los electrones en la reacción redox por cadenas
transportadoras de electrones
• REACCION DE LA ADENILATO QUINASA: ATP cede un fosfato a una molécula de
AMP, para formar dos moléculas de ADP
VÍAS METABÓLICAS
• IRREVERSIBLES
• ETAPA OBLIGADA
• REGULADAS → Regulación del paso limitante (normalmente, la etapa obligada). Hay un
equilibrio entre la energía que necesito y la que tengo.
• DIFERENTE LOCALIZACIÓN CELULAR. Rutas anabólicas y catabólicas ocurren
simultáneamente en diferentes compartimentos
Tiene que estar regulado para establecer un equilibrio entre los metabolitos y el
requerimiento metabólico de un órgano/tejido
3
TEMA 7. METABOLISMO DE LOS CARBOHIDRATOS
RUTA CATABOLICA DEGRADATIVA
CITOPLASMA
GLUCOLISIS
10 REACCIONES
1 glucosa → 2 piruvatos.
Intermediarios metabólicos
están fosforilados: Grupo polar
de reconocimiento y sirven para
mantener la energía del proceso
(transferidos al ADP para
formar ATP)
BENEFICIO NETO:
4
GLUCONEOGÉNESIS RUTA ANABÓLICA
CITOPLASMA (HÍGADO y RIÑON)
10 REACCIONES
2 piruvatos → 1 glucosa
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METABOLISMO DEL GLUCÓGENO
GLUCOGENOGÉNESIS
• BIOSÍNTESIS DE GLUCÓGENO
Después de la ingestión, aumentarán los niveles de glucosa, y esta glucosa se almacenará en
el músculo y en el hígado en forma de glucógeno.
2- ENZIMA RAMIFICANTE
Crea los puntos de ramificación mediante enlaces (α 1 → 6).
Esta enzima actúa en zonas intermedias, no actúa en el extremo NO reductor. Además,
es necesario que la cadena de glucosa tenga mínimo 11 residuos de glucosa para que la
enzima actúe en una de sus glucosas centrales.
GLUCOGENOLISIS
2- ENZIMA DESRAMIFICANTE
Esta enzima elimina los puntos de ramificación.
- Actividad transglucosilasa. Transfiere una cadena de moléculas de glucosa (1 → 4) a
una cadena central de glucógeno, dejando sólo la molécula de glucosa (1 → 6)
- Actividad glucosidasa. Hidroliza (añade H2O) en el último residuo para liberar la última
glucosa (la que comienza la ramificación) que está con el enlace (1 → 6).
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CICLO DE CORI
Consiste en el reciclaje de lactato que se produce en el músculo cuando este tiene una alta
demanda de energía pero NO O2. Entonces se generará un lactato que solo podrá ser
reusado en el hígado.
VENTAJAS
- Evitar la acidosis láctica
muscular y sanguínea
- Recuperar glucosa a partir de
lactato
- Redistribución de reservas de
glucógeno muscular
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TEMA 8. RUTAS CENTRALES DEL METABOLISMO
INTERMEDIARIO
CATABOLISMO
Reacciones del metabolismo degradativas y que sirven para producir energía
ANABOLISMO
Reacciones del metabolismo sintetizadoras y que requieren energía.
PRINCIPIOS DE BIOENERGÉTICA
OXIDACIÓN: Eliminación de un electrón (o electrones) de una sustancia. Una sustancia
oxidante en un donador de electrones o fuente de energía
REDUCCIÓN: Adición de un electrón (o electrones) a una sustancia. Una sustancia
reducida es una aceptor de electrones
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DESCARBOXILACIÓN OXIDATIVA DEL PIRUVATO
PIRUVATO A ACETIL-COA
El piruvato se genera gracias a la ruta de la glucólisis.
Es un metabolito intermedio aprovechado por rutas
metabólicas:
• Catabólicas: Fermentaciones (láctica y alcohólica) y
descarboxilación oxidativa del piruvato
• Anabólicas: Gluconeogénesis
Con la finalidad de aumentar la producción de energía o
servir para la síntesis de diversas moléculas
(aminoácidos).
PASOS CATABÓLICOS
- Se transporta el piruvato al interior de la mitocondria
- Ocurre la descarboxilación oxidativa del piruvato al acetil-CoA, en la matriz
mitocondrial, para sus productos sean rápidamente aprovechados por el ciclo de Krebs
o la cadena transportadora de electrones. Es una reacción IRREVERSIBLE
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CICLO DE KREBS
Creado por HANS ADOLF KREBS
- El grupo acetilo del acetil-CoA se oxida hasta CO2
- Proceso cíclico de 8 reacciones
- Ocurre en la matriz mitocondrial
- El piruvato entra en la mitocondria y se transforma en acetil-CoA (2C)
Es una ruta metabólica cíclica que funciona como un nexo de unión entre catabolismo y
anabolismo. Además, es una ruta anfibólica, ya que puede servir tanto para el catabolismo
como para el anabolismo, en función de cómo se emplee. Forma parte de la respiración
celular típica de los organismos aeróbicos.
Las RUTAS ANFIBÓLICAS son reacciones químicas metabólicamente mixtas que algunas
fases son propias del catabolismo y otras del anabolismo. Esto permite que den metabolitos
a otras rutas y también que recojan los metabolitos de otras. Son piezas centrales del
metabolismo.
El ciclo de Krebs permite interconectar las principales rutas metabólicas de los hidratos
de carbono, de los lípidos y de los aminoácidos (proteínas); de forma que un tipo de
biomolécula puede servir de precursor para otros tipos de biomoléculas, lo cual supone
optimizar los recursos disponibles por la célula y depender en menor medida de los aportes
exógenos, principalmente de la dieta
Las fermentaciones forman una serie de rutas metabólicas que permiten reciclar el NAD+
gastado en la formación NADH+H+ en la glucólisis. En estos organismos carentes de
mitocondrias, la regeneración del NAD+ a través de las fermentaciones es crucial y la
escasez de NAD+ podría bloquear la glucólisis.
¿POR QUÉ? Las células NO utilizan la energía de las reacciones de oxidación tan pronto
como se produce. La convierten en moléculas pequeñas y ricas en energía como ATP y
NADH, que se pueden utilizar en toda la célula para impulsar el metabolismo y construir
nuevos componentes celulares. Las enzimas usan esta energía para catalizar o acelerar las
reacciones químicas dentro de la célula que de otra manera ocurrirían muy lentamente
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1. CONDENSACIÓN ALDÓLICA seguida de hidrólisis que libera la CoA libre
ACETIL COA (2C) + OXOLACETATO (4C) → CITRATO (6C) IRREVERSIBLE
7. HIDRATACIÓN
FUMARATO → L-MALATO
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BALANCE ENERGÉTICO
En los sistemas vivos, los electrones involucrados en las oxidaciones celulares NO pasan
directamente al oxígeno, sino que se transfieren a través de vías con múltiples etapas. Los
electrones de las oxidaciones se utilizar para reducir el NAD+ a NADH + H+ y FAD a
FADH2. Estos electrones fijados a las coenzimas pasan a la cadena transportadora de
electrones, por la reoxidación mitocondrial del NADH + H + a NAD+ y del FADH2 a FAD
En este proceso, una serie de protones se transfieren desde la matriz mitocondrial hacia el
espacio intermembrana de la mitocondria, de modo que se crea un gradiente de protones
(gradiente electroquímico), el cual impulsa la síntesis de ATP, a partir de ADP y Pi, a través
de la fosforilación oxidativa. Por lo tanto, este proceso está implicado en la producción de
energía de la célula.
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COMPLEJOS Y TRANSPORTE ELECTRÓNICO
En la cadena respiratoria intervienen 3 tipos de moléculas capaces de transferir
electrones:
▪ UBIQUINONA O COENZIMA Q: es una benzoquinona soluble en lípidos con una larga
cadena lateral isoprenoide. Por su pequeño tamaño e hidrofobicidad se puede mover
por la bicapa lipídica de la membrana interna mitocondrial.
▪ CITOCROMOS. Proteínas con una fuerte absorción de luz visible ya que tienen como
grupos prostéticos grupos hemo conteniendo hierro.
La mitocondria contiene citocromos a, b y c
▪ PROTEÍNAS SULFO-FÉRRICAS (centros Fe-S). El hierro está asociado con átomos de
azufre inorgánico o con residuos de Cys.
Los electrones del FADH2 entran en la cadena transportadora a través del complejo II
y los electrones se transfieren a la ubiquinona, luego al complejo III, al citocromo c, al
complejo IV y finalmente, al O2 formándose H2O.
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• COMPLEJO III o citocromo bc1. Además, mencionamos el complejo ubiquinona:
citocromo c oxidorreductasa
QH2 + 2cyt c (oxidized) + 2H+N → Q + 2cyt c(reduced) + 4H+P
Conduce a los electrones desde el citocromo c hasta el último aceptor de los electrones,
el oxígeno, que se reduce a H2O. 7 subunidades proteicas
Este proceso necesita 4 electrones y la presencia de citocromos a y de dos átomos de
cobre que colaboran para reducir el O2
Por cada dos electrones que atraviesan este complejo, la enzima consume dos H+ de la
matriz al convertir ½ O2 en H2O. Además, utiliza la energía para bombear 2H+ hacia el
espacio intermembrana para cada 2 electrones que pasan.
Los electrones del FADH2 son transferidos a través de los complejos II (no bombea
protones), III, IV hasta el oxígeno. Este trasiego permite el paso total de 6H+ por
molécula al espacio intermembrana, ya que no pasa por el complejo I
Los electrones del NADH crean un mayor gradiente electroquímico que el FADH 2, al
utilizar el complejo I y NO el complejo II (que no transfiere protones) y este trasiego
permite el paso total de 10H+ por molécula al espacio intermembrana.
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FOSFORILACIÓN OXIDATIVA
La ATP sintasa o complejo V, aprovecha la fuerza protón-motriz de vuelta de los H+ a
la matriz mitocondrial para formar ATP (a partir de ADP y Pi). Esta síntesis de ATP está
acoplada al transporte de electrones mitocondrial. Es la “Teoría quimiosmótica de
acoplamiento” que Mitchell propuso en 1961.
Los pacientes que sufrieron intoxicación por CO, tienen síntomas como arritmias cardiacas,
dolor torácico, problemas respiratorios, vómitos. Estos pueden mejorar administrando oxígeno
normobárico (NBO) o recibir un tratamiento con oxigenación hiperbárica (HBO)
Estos pacientes tienen posibilidad de desarrollar el Síndrome Neurológico Tardío.
• AGENTE CIANÓGENOS
Como el cianuro de hidrógeno o el cloruro de cianógeno, utilizados en ataques terroristas o en
las cámaras de gas nazis (gas Zyclón), son compuestos de acción muy rápida y letal, que
contienen el ión cianuro, CN-, un veneno celular que impide la transferencia de electrones.
• ROTENONA
Es un producto vegetal usado como insecticida y pesticida, interfiriendo en el complejo I.
• ANTIMICINA
Es un antibiótico usado como veneno para controlar especie de peces, e interfiere en el
complejo III.
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TEMA 9: METABOLISMO DE GLÚCIDOS II: RUTA DE LAS
PENTOSAS FOSFATO
RUTA CATABÓLICA
RUTA DE LAS PENTOSAS FOSFATO es una ruta CITOPLASMA
catabólica que parte de la glucosa. Glucosa → Poder reductor y
Se obtiene energía pero NO en forma de ATP monosacáridos
La glucosa 6-P tiene otros destinos catabólicos para obtener productos que necesita la célula
Las células en división rápida, como las de la médula ósea, la piel y la mucosa intestinal, y
los de los tumores necesitan la ribosa 5-P para producir ácidos nucleicos (ARN, ADN) y
coenzimas (ATP, NADH, FADH2 y coenzima A), por ejemplo, el NADPH, se utiliza para la
síntesis de ácidos grasos, y para formar lípidos de membrana
16
FASES DE LA RUTA DE LAS PENTOSAS FOSFATO
17
CUATRO MODOS DE LAS VÍAS DE LA RUTA
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TEMA 10. METABOLISMO DE LOS LÍPIDOS
Los LÍPIDOS son un conjunto heterogéneo de biomoléculas insolubles en agua, solubles en
disolventes orgánicos y untuosos al tacto. Formados por C, H y O, y además N, P y S.
- Lípidos saponificables: formados por ésteres de ácidos grasos. En presencia de NaOH
o KOH, dan jabones: Acilglicéridos (triacilglicéridos), ceras y lípidos complejos
(fosfoglicéridos, esfingolípidos)
- Lípidos insaponificables: NO contienen ácidos grasos, no pueden formar jabones:
Terpenos, esteroides y eicosanoides o icosanoides
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ABSORCIÓN DE LOS LÍPIDOS
Las lipasas son las enzimas intestinales, que son secretadas por el páncreas.
• Las sales biliares son compuestos anfipáticos que actúan como detergentes biológicos,
convirtiendo las grasas en micelas mixtas de sales biliares y triacilgliceroles.
• Las micelas aumenta la cantidad de lípidos accesible a la acción de las lipasas
hidrosolubles del intestino que convierten los triacilgliceroles en: monoacilgliceroles,
diacilgliceroles, ácidos grasos libres y glicerol.
• Estos productos difunden en las células epiteliales que recubren la mucosa intestinal y
una vez dentro se reconvierten a triacilgliceroles empaquetados con colesterol y
proteínas específicas en agregados de lipoproteínas llamados quilomicrones.
QUILOMICRONES
Los quilomicrones son partículas estables de 200 nm de diámetro, formadas por
triacilgliceroles con apolipoproteína B-48 (apo B-48) como principal componente proteico.
Por eso, los componentes proteicos de las partículas lipoproteicas son las apolipoproteínas.
Los quilomicrones se unen a las lipasas unidas a la membrana, donde los triacilgliceroles son
de nuevo degradados en ácidos grasos libres y monoacilgliceroles para su transporte.
Los triacilgliceroles luego se resintetizan dentro de la célula adiposa y son almacenados.
LIPOPROTEÍNAS
Las lipoproteínas son unas estructuras complejas que transportan los lípidos por el
organismo, a nivel sanguíneo y linfático. La disposición típica de una lipoproteína está
formada por una capa externa anfipática formada por fosfolípidos, apoproteínas y
colesterol libre; y en el interior se acumulan TG y colesterol, compuestos hidrofóbicos.
TIPOS DE LIPOPROTEÍNAS:
Se diferencian por su densidad y tamaño. Las diferencias de densidad permiten su
aislamiento mediante técnicas de ultracentrifugación o de electrofóresis.
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ENFERMEDADES DE LOS LÍPIDOS
Las DISLIPEMIAS son enfermedades caracterizadas por el acúmulo o falta de alguna
lipoproteína en plasma. Si hay un acumulo se llama HIPERLIPOPROTEINEMIAS. Estas
patologías suelen tener un carácter genético, aunque factores como el alcoholismo, el
sedentarismo, la obesidad o dietas hipercalóricas muy ricas en grasas también contribuyen
a agravar estas patologías.
Es necesario conocer su riesgo aterogénico (capacidad de que desencadenen la formación
de placas de ateromas, que suelen ser depósitos de colesterol), el cual está relacionado con
accidentes cardiovasculares graves. El tratamiento de esas dislipemias requiere un control
dietético y, en casos con mayor riesgo como hipercolesterolemias, tratamiento
farmacológico.
Las dislipemias con descenso o desaparición de lipoproteína: HIPOLIPOPROTEINEMIAS.
LIPOLISIS
La lipólisis es el mecanismo de movilización de los lípidos que están almacenados como
reservorio de energía. Esta movilización sucede cuando hay una deficiencia del aporte
energético o cuando se ayuna.
Los lípidos acumulados en forma de triacilglicéridos están en forma anhidra, como gotitas
de grasa, en el citoplasma de los adipocitos.
Las lipasas encargadas de la lipolisis están en la superficie de la gota de grasa, que en
respuesta a una estímulo hormonal aumentan su número o son reclutadas desde el citosol.
Estos ácidos grasos son liberados al medio extracelular.
TEJIDO ADIPOSO:
HORMONAS (glucagón y adrenalina) → activan RECEPTOR (7TM) → activan ADENILATO
CICLASA → aumenta NIVEL DE AMPc → estimula PROTEÍNA QUINASA A →
fosforila PERILIPINA (asociada a gotas de grasa) y LIPASA SENSIBLE A HORMONAS
(HS)
MOVILIZACIÓN DE TRIACILGLICEROLES
CA+ATGL → libera Ac. graso → diacilglicerol → HS → Ac.graso libre + monoacilglicerol →
monoacilglicerol lipasa (MAG) → Ac. graso libre + glicerol
Los ácidos grasos salen del adipocito y se unen en sangre a la albúmina, una proteína
plasmática (también llamada VHDL, lipoproteínas de muy alta densidad) que transporta
entre 2-4 moléculas de ácidos grasos, aunque puede transportar hasta 6.
Estos ácidos grasos movilizados llegan hasta el hígado, el músculo cardiaco y el músculo
esquelético. Ahí los ácidos grasos serán oxidados en una vía metabólica: Β-OXIDACIÓN,
para producir grandes cantidades de energía.
GLICEROL → SANGRE → HÍGADO→ glicerol quinasa + glicerol-3-P deshidrogenasa →
DIHIDROXIACETONA-P → gluconeogenesis (nivel hepático) / glucolisis (energía)
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B-OXIDACIÓN
Proceso degradativo de los ácidos grasos por RUTA CATABÓLICA
sucesivas oxidaciones en el carbono β, que van MATRIZ MITOCONDRIAL
separando fragmentos de 2C en forma de acetil- Ácidos grasos → Acetil-CoA
CoA hasta su oxidación.
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3. DEGRADACIÓN del ác.graso a moléculas de acetil-CoA (MATRIZ)
Dentro de la matriz mitocondrial, las moléculas de acil-CoA
comienzan el proceso degradativo
• HIDRATACIÓN
ENOIL-CoA → enoil-CoA hidratasa → HIDROXIACIL-CoA
Se introduce una H2O al doble enlace C=C, quedando el Cβ con un OH y el Cα con un H.
La hidratación de enoil-CoA es estereoespecífica. Sólo se forma el isómero L de 3-
hidroxiacil CoA.
• DESHIDROGENACIÓN
HIDROXIACIL-CoA → hidroxiacil-CoA deshidrogenasa → CETOACIL-CoA,
Se oxida el grupo OH- a un grupo ceto. Se obtiene 1×NADH (cadena transportadora)
• RUPTURA TIÓLICA
CETOACIL-CoA → tiolasa → ACIL-CoA (2c MENOS) + 1×ACETIL-CoA (al CAC)
El acil-CoA acortado en 2C, inicia una nueva “vuelta”. El ciclo se repite tantas veces hasta
“cortar” totalmente la cadena de ácido graso en fragmentos de acetil-CoA de 2C.
Los últimos tres pasos de esta secuencia son catalizados por dos conjuntos de enzimas
según la longitud de la cadena de ácido graso.
Para las cadenas de 12 O MÁS CARBONOS, las reacciones son catalizadas por un
complejo multienzimático, la proteína trifuncional (TFP), un heterooctámero de
subunidades α4β4. Cada subunidad α contiene dos actividades, la enoil-CoA hidratasa y la
β-hidroxiacil-CoA deshidrogenasa; las subunidades β contienen la actividad tiolasa.
Cuando la TFP ha acortado la cadena a 12 o menos carbonos, las oxidaciones adicionales
son catalizadas por un conjunto de cuatro enzimas solubles en la matriz.
23
CARBONOS IMPARES, INSATURADOS Y RAMIFICADOS
24
OXIDACIONES SECUNDARIAS DE LOS ÁCIDOS GRASOS
Existen variantes de la β-oxidación, para cubrir diferentes necesidades celulares.
En los peroxisomas se origina una variante en la que la acil-CoA deshidrogenasa transfiere
los electrones al O2 formando peróxido de hidrógeno, empleado en estos orgánulos como
agente oxidante y para facilitar su actividad degradativa. Esta β-oxidación presenta
especificidad por ácidos grasos de cadena larga.
Existen otras rutas para degradar ácidos grasos como la α-oxidación y la ω-oxidación. En
estas rutas la oxidación va precedida de la hidroxilación de un carbono:
α-OXIDACIÓN.
Hidroxilación del carbono α → oxidación a carbonilo + descarboxilación del C1 en forma
de CO2. Importante en la oxidación de ácidos grasos metilados: ácido fitánico.
ω-OXIDACIÓN.
Hidroxilación del último carbono → oxidación secuencial a aldehído y a carboxilo.
• El O2 de 1ª reacción es oxígeno molecular e involucra a citocromo P450 y al NADPH
• la alcohol deshidrogenasa que oxida el grupo hidroxilo a un aldehído
• la aldehído deshidrogenasa que oxida el grupo aldehído a un ácido carboxílico
Importante para la formación de ácidos dicarboxílicos que pueden entrar en la β-oxidación
por ambos lados, degradándose más rápidamente. Los sustratos preferidos son los ácidos
grasos de 10-12 C.
En mamíferos, la ω-oxidación es una vía menor para la degradación de los ácidos grasos,
pero cuando la β-oxidación es defectuosa (ej.: mutación o deficiencia de carnitina) se
vuelve más importante.
25
La acetona se exhala por la respiración
El acetoacetato y el D-β-hidroxibutirato: hígado → tejidos extrahepáticos (músculo
cardiaco, esquelético, riñón), se convierten en acetil-CoA y se oxidan en el CAC.
El cerebro, que utiliza glucosa como combustible, puede adaptarse al acetoacetato y D-β-
hidroxibutirato en condiciones de inanición, cuando la glucosa no está disponible.
Aquí, el cerebro no puede utilizar los ácidos grasos, porque no atraviesan la barrera
hematoencefálica.
La producción y exportación de cuerpos cetónicos de HÍGADO → EXTRAHEPÁTICOS
permite la oxidación continua de los ácidos grasos con una oxidación mínima de acetil CoA:
Cuando los intermediarios del CAC se desvían para crear glucosa mediante
gluconeogénesis, la oxidación de los intermedios del ciclo y la oxidación de acetil-CoA se
ralentiza .
Además, el hígado tiene una cantidad limitada de CoA, y cuando la mayoría está ligada a
acetil-CoA, la β-oxidación se ralentiza por falta de la CoA libre. La producción y
exportación de cuerpos cetónicos libera la CoA, permitiendo la oxidación continua de los
ácidos grasos.
26
CETOGÉNESIS
Proceso de formación de los cuerpos cetónicos
Los cuerpos cetónicos que son asimilados por los tejidos extrahepáticos se utilizan para
producir moléculas de acetil CoA que serán degradadas en el CAC:
27
PATOLOGÍAS DE LOS CUERPOS CETÓNICOS
Un aumento importante de los niveles de los cuerpos cetónicos en sangre puede originar
cetoacidosis, que es un trastorno grave que puede poner en riesgo la vida y que exige
tratamiento inmediato. Algunos síntomas son vómitos, dolor abdominal, pérdida de
conciencia.
La más común de estas afecciones es la cetosis diabética en pacientes con diabetes
mellitus Insulinodependiente, los cuales no pueden producir insulina. Esta hormona, que
normalmente se libera después de las comidas, indica a los tejidos que absorban glucosa.
Además, reduce la movilización de ácidos grasos por el tejido adiposo.
Las dietas que promueven la formación de cuerpos cetónicos se suelen utilizar como una
opción terapéutica para los niños con epilepsia resistente a los medicamentos.
Las dietas cetogénicas son ricas en grasas y bajas en carbohidratos, con cantidades
adecuadas de proteínas. En esencia, el cuerpo se ve obligado a pasar hambre, donde las
grasas y los cuerpos cetónicos se convierten en la principal fuente de combustible.
Investigaciones sugieren que las dietas cetogénicas alteran la flora intestinal, el
microbioma, siendo esta alteración responsable de los efectos terapéuticos de la dieta. El
microbioma alterado regula los niveles de ciertos neurotransmisores, reduciendo así las
convulsiones.
Debido a que la dieta occidental típica satisface nuestras necesidades, los adultos tienen
poca necesidad de síntesis de nuevos ácidos grasos. El acetil-CoA es el precursor de la
síntesis de los ácidos grasos.
Sin embargo, la síntesis de ácidos grasos es necesaria durante el desarrollo embrionario y
la lactancia en las glándulas mamarias. Además, una síntesis inadecuada de ácidos grasos
en el hígado contribuye a la insuficiencia hepática
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Hay DOS VARIANTES de ácido graso sintasa:
➢ ÁCIDO GRASO SINTASA I (FAS I). En vertebrados y hongos. Es UNA cadena
polipeptídica multifuncional con 7 sitios activos.
Un FAS I algo diferente se encuentra en levaduras y otros hongos. Formado por DOS
polipéptidos multifuncionales.
La síntesis de ácidos grasos produce un producto, y no se liberan intermedios. Cuando
la longitud de la cadena alcanza los 16C, el producto abandona el ciclo.
➢ ÁCIDO GRASO SINTASA II (FAS II). En plantas, bacterias y vertebrados. Es un
sistema disociado; cada paso de la síntesis es catalizado por una enzima. Los
intermedios son difusibles y pueden desviarse hacia otras vías. Además, genera
variedad de productos (ác. grasos saturados, insaturados, ramificados e hidroxi)
EN EL CITOPLASMA
La biosíntesis necesita la participación del malonil-CoA (3C) que no aparece en la ruta de
degradación. Y además, NADPH + H+ y Acetil-CoA.
1. CONDENSACIÓN
ACETILO + MALONILO → β-cetoacil-ACP sintasa → ACETOACETIL-ACP + CO2
3. DESHIDRATACIÓN
HIDROXIBUTIRIL-ACP→ β-hidroxiacil-ACP deshidratasa→ TRANS-A2-BUTENOIL-ACP
Ocurren 7 ciclos que producen el grupo palmitoilo saturado (16C) unido todavía al ACP. El
alargamiento de la cadena se detiene en este punto, liberándose palmitato libre por la
acción hidrolítica de la tioesterasa.
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El ÁCIDO PALMÍTICO O PALMITATO, es el principal precursor de otros ácidos grasos
de cadena larga. Puede formar ESTEARATO o ácidos grasos saturados MÁS LARGOS
mediante sistemas de elongación presentes en el REL y en las mitocondrias, se forman el
resto de ácidos grasos. Estas reacciones están catalizadas por la ácido graso elongasa
Los electrones obtenidos del NADPH, pasan por una flavoproteína (citocromo b5
reductasa), luego por el citocromo b5 y llegan al O2, encargado de oxidar al ácido graso y
generar un doble enlace en este. Esta ruta del flujo de electrones, al igual que la acil
graso-CoA desaturasa, se encuentra en el REL.
Las plantas pueden sintetizar ácido linoleico, un ácido graso con 2 dobles enlaces (C9 y
C12). y α-linolénico, con 3 dobles enlaces, C9, C12 y C15.
Estos dos ácidos grasos son importantes porque en nuestro organismo los necesitamos para
generar otros productos importantes para el metabolismo. Son ácidos grasos esenciales
30
➢ REGULACIÓN DE BIOSÍNTESIS DE ÁCIDOS GRASOS
Cuando una célula tiene combustible suficiente, el exceso se convierte en ác.grasos y se
almacena en forma de lípidos. La reacción catalizada por la acetil-CoA carboxilasa es el
paso limitante en la síntesis de ácidos grasos y un sitio importante de regulación
• PALMITOIL-CoA, inhibe alostéricamente la enzima
• CITRATO. Estimula alostéricamente a la enzima.
SÍNTESIS DE TRIGLICÉRIDOS
La síntesis de los triacilglicéridos, ocurre en el retículo endoplásmico liso (REL) de células
adiposas y hepáticas, y se origina mediante la esterificación secuencial de una molécula de
glicerol-3-P con 3 acil-CoA (ácidos grasos activados).
Requiere la formación previa del ácido fosfatídico: 2 ácidos grasos, glicerol y 1 P, el cual
está en pequeñas cantidades, pero es un intermedio central en la biosíntesis de los lípidos.
SÍNTESIS DE TRIACILGLICÉRIDOS
FOSFATÍDICO → fosfatasa → DIACILGLICEROL → acil-transferasa → TRIGLICÉRIDO
- citoplasma (adipocitos)
- vesículas de secreción (lipoproteínas, intestino o hígado)
31
SÍNTESIS DE COLESTEROL
El colesterol tiene un papel crucial como componente de las membranas celulares y
precursor de las hormonas esteroides, los ácidos biliares y vitamina D. Es una molécula
esencial pero no se requiere en la dieta ya las células podrían sintetizarlo a partir de
precursores simples, aunque el típico órgano de síntesis es el hígado.
El colesterol tiene 27 C que son proporcionados por el acetato.
La última reacción utiliza 2 NADPH, los cuales donan 2 electrones cada uno.
MEVALONATO → 5-PIROFOSFOMEVALONATO →
ISOPENTENIL PIROFOSFATO (1º isopreno)
DIMETILALIL PIROFOSFATO (2º isopreno)
32
➢ REGULACIÓN DE COLESTEROL
La síntesis de colesterol es un proceso complejo y energéticamente costoso.
El exceso de colesterol NO puede catabolizarse para su uso como combustible y debe
excretarse. Por lo tanto, es ventajoso para un organismo regular la biosíntesis del
colesterol para complementar la ingesta dietética.
En los mamíferos, la producción de colesterol está regulada por:
▪ la concentración de colesterol intracelular,
▪ el suministro de ATP
▪ las hormonas glucagón e insulina.
El paso comprometido en la ruta hacia el colesterol y un sitio importante de regulación es
la conversión de HMG-CoA en mevalonato.
33
DESTINOS DEL COLESTEROL
La mayoría de la síntesis de colesterol en los vertebrados ocurre en el hígado.
Una pequeña fracción del colesterol que se produce allí se incorpora a los hepatocitos,
pero la mayoría se exporta en ácidos biliares, colesterol biliar o ésteres de colesterol.
En otros tejidos, el colesterol se convierte en hormonas esteroideas (corteza suprarrenal y
gónadas) o en la vitamina D (hígado y riñones).
Los ácidos biliares son los componentes principales de la bilis, un líquido almacenado en la
vesícula biliar y excretado en el intestino delgado para ayudar en la digestión de las
comidas que contienen grasas.
Los ácidos biliares y sus sales (sódicas o potásicas) son derivados del colesterol hidrófilos
(con regiones polares y apolares) que sirven como emulsionantes en el intestino,
convirtiendo grandes partículas de grasa en diminutas micelas y aumentando así la
superficie en la que pueden actuar las lipasas digestivas.
Además de las sales biliares, la bilis está formada de colesterol, fosfolípidos y los
productos de degradación del hemo, bilirrubina y biliverdina.
Demasiado colesterol presente en la bilis precipitará formando cálculos en la vesícula biliar
(colelitiasis), que pueden bloquear la secreción de bilis e inflamar la vesícula biliar.
Si es necesario, se extrae la vesícula biliar y la bilis fluye desde el hígado a través del
conducto biliar directamente al intestino.
34
La síntesis de hormonas esteroides requiere la eliminación de algunos o todos los C de la
cadena lateral del C17 del anillo D del colesterol. La eliminación de las cadenas laterales
ocurre en las mitocondrias de los tejidos esteroidogénicos y requiere la hidroxilación de
2C adyacentes en la cadena lateral seguida de la ruptura del enlace entre ellos.
La formación de las diversas hormonas también requiere la introducción de átomos de O2.
APLICACIONES INDUSTRIALES
El isopentenil pirofosfato (C5) es el precursor activado de muchas biomoléculas
La síntesis de escualeno (C30) ejemplifica un mecanismo fundamental para el ensamblaje
de esqueletos de carbono de biomoléculas.
FUNCIONES:
▪ Evitan el daño oxidativo de las células, por lo que se estudia en: enfermedades
crónicas (cardiovasculares, cáncer) y degenerativas (Alzheimer, Parkinson)
▪ Protegen las moléculas fotosintéticas en la fotosíntesis
▪ Papel ecológico importante en la atracción de polinizadores para la dispersión de
semillas
▪ Los carotenoides bloquean los efectos naturales de las especies reactivas de oxígeno
en las células de la piel
▪ La agricultura intensiva y la acuicultura necesitan suplementos alimenticios que imiten
los pigmentos naturales presentes en diferentes animales (salmón, trucha, crustáceos)
y tejidos o productos (yemas de huevo, piel, patas, grasa, picos, plumas).
35
TEMA 11- DEGRADACIÓN DE PROTEÍNAS
Las PROTEÍNAS son polímeros lineales de L-aminoácidos unidos mediante enlace
peptídico. Son cadenas de alto peso molecular formadas por residuos de aminoácidos, y se
diferencian entre sí por el número, tipo, orden de los aa de su cadena.
Todas las proteínas realizan su función por unión selectiva a moléculas, y además, la
función de las proteínas se basa en su estructura tridimensional.
Las proteínas estructurales se unen entre sí, para crear una estructura mayor, y otras se
unen a moléculas distintas, como:
• Los anticuerpos a los antígenos específicos
• La hemoglobina al oxígeno
• Las enzimas a sus sustratos
• Los reguladores de la expresión génica al ADN
• Las hormonas a sus receptores específicos
ESTRUCTURA DE PROTEÍNAS
La estructura de las proteínas depende del orden secuencial de los aa que las forman y de
la organización espacial de la cadena proteica. Además, está condicionada por las
características físicas de su entorno y compuestos que interaccionan con ellas
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ENLACE PEPTÍDICO
El grupo ácido de un aa se une con el grupo amino de otro, mediante un enlace peptídico, y
se forma un dipéptido. Es una reacción de condensación en la que se produce amida y H2O.
Los átomos que están unidos al C y al N del enlace, tienen unas distancias y unos ángulos, y
están todos en un mismo plano. Dada la rigidez del enlace peptídico, la conformación de las
proteínas depende de la rotación de los enlaces N-Cα y Cα-C que unen dos enlaces
peptídicos adyacentes y sí pueden girar libremente.
DEGRADACIÓN DE PROTEÍNAS
La degradación de las proteínas se estudia a dos niveles, según la localización del proceso.
• TRACTO DIGESTIVO: Ocurre la digestión de las proteínas, donde se procesan las
proteínas exógenas o ingeridas de la dieta.
Este proceso digestivo permite obtener los aminoácidos en forma libre, necesarios para
sintetizar: proteínas propias y otras biomoléculas que se forman a partir de ellos.
PROTEASAS
Los enlaces peptídicos son altamente estables en condiciones fisiológicas y las células
necesitan un mecanismo capaz de romper estos enlaces.
Las proteasas separan los enlaces peptídicos de las proteínas y son fundamentales en el
procesamiento de antígenos, la apoptosis, la eliminación de proteínas de superficie, la
señalización celular y obtención de aminoácidos libres
37
La PROTEÓLISIS : Reacción termodinámicamente favorable e irreversible. La actividad
de la proteasa está regulada para evitar la proteólisis incontrolada a través de
mecanismos de control temporal y/o espacial.
Existen más de 11.000 proteasas que varían en la especificidad de sustrato, el mecanismo
de escisión del péptido, ubicación en la célula, duración de la actividad…
Según los grupos de los sitios activos de la proteasa que participan en la proteólisis:
• SERÍN (ENDO)PROTEASAS O PROTEASAS DE SERINA: tiene un residuo de serina en
el centro activo de la enzima. pH óptimo: 7-12. Ej: tripsina, quimiotripsina y subtilisinas.
• CISTEÍN PROTEASA: una cisteína y una histidina en el sitio catalítico. Suele requerir
agentes reductores para retener la actividad catalítica. Ej: papaina.
• ASPARTIL-PROTEASAS: conjunto de enzimas proteolíticas distribuidas por el
organismo, donde desempeñan funciones fisiológicas y procesos patológicos. Contienen
dos residuos de aspártico en el centro activo. pH óptimo: 3-4. Ej: pepsinógeno C.
• METALOPROTEASAS: requieren un catión divalente unido (Zn2+). Tiene implicaciones
en desarrollo embrionario y formación ósea, toxinas tetánicas y botulínicas,
reproducción, artritis y cáncer. Ej: termolisina.
PATOLOGÍAS
Patologías pancreáticas o intestinales pueden producir déficit de ciertas enzimas
digestivas. Un procesamiento incorrecto de las proteínas ingeridas hace que NO puedan
ser absorbidas ni aprovechadas. Se puede recurrir a la ingestión de hidrolizados de
proteínas.
La pancreatitis aguda es una enfermedad causada por la obstrucción de la vía normal por la
cual las secreciones pancreáticas ingresan al intestino.
Los zimógenos de las enzimas proteolíticas se convierten prematuramente en sus formas
catalíticamente activas, dentro de las células pancreáticas, y atacan el tejido pancreático
mismo. Esto provoca dolor insoportable y daños en el órgano.
Cuando las personas celíacas consumen gluten, esto desencadena una respuesta inmune. Con
el tiempo, la inflamación causada por la respuesta inmune daña las vellosidades. Debido al
daño, las vellosidades no pueden absorber bien el hierro, las vitaminas y otros nutrientes, y
provoca síntomas como diarrea, fatiga, pérdida de peso, etc.
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DIGESTIÓN EXÓGENA
Digestión de las PROTEÍNAS EXÓGENAS en el
tracto digestivo para generar aminoácidos libres.
En el ser humano, hay aminoácidos esenciales (se consiguen de la dieta): isoleucina, leucina,
lisina, metionina, fenilalanina, treonina, triptófano, valina, histidina y arginina. Estos dos
últimos son semiesenciales (dependen de los componentes de la alimentación).
El resto de aa son no esenciales, porque el organismo tiene enzimas para su biosíntesis
El jugo gástrico ácido (pH de 1,0 a 2,5) es un antiséptico, mata bacterias y células
extrañas, y un agente desnaturalizante, que despliega las proteínas globulares y hace que
sus enlaces peptídicos internos sean más accesibles a la hidrólisis enzimática.
A nivel estomacal también interviene la renina, proteasa que actúa sobre las caseínas de la
leche permitiendo su digestión, siendo muy importante en el período lactante.
Las cadenas polipeptídicas largas → péptidos más pequeños . Aun así, estas enzimas
estomacales suelen generar grandes fragmentos peptídicos que pasan al intestino
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A medida que el contenido ácido del estómago pasa al intestino delgado, el pH bajo
desencadena la secreción de la hormona secretina en la sangre.
La secretina estimula al páncreas para que secrete bicarbonato en el intestino delgado
para neutralizar el HCl gástrico, aumentando el pH a 7,0. Las secreciones pancreáticas
pasan al intestino delgado a través del conducto pancreático.
La llegada de aminoácidos al duodeno, provoca la liberación en la sangre de la hormona
colecistoquinina, que estimula la secreción de varias enzimas pancreáticas.
Los dipéptidos, tripéptidos y aminoácidos libres se asimilan por las células intestinales, al
nivel del yeyuno, mediante transportadores específicos dependientes de Na +, en el proceso
conocido como ABSORCIÓN INTESTINAL.
En los seres humanos, la mayoría de las proteínas globulares de origen animal se hidrolizan
casi por completo en aminoácidos en el tracto gastrointestinal, pero algunas proteínas
fibrilares, como la queratina, solo se digieren parcialmente. Además, el contenido de
proteínas de algunos alimentos vegetales está protegido contra la degradación por la
celulosa que las hace no digeribles.
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METABOLISMO DE AMINOÁCIDOS. GRUPOS AMINO
La cantidad de energía metabólica obtenida de los aa, ya sean derivados de la proteína de
la dieta o de la proteína tisular, varía según el organismo y las condiciones metabólicas.
▪ Los MICROORGANISMOS utilizan los aminoácidos como combustible cuando lo
requieran las condiciones metabólicas.
▪ Los HERBÍVOROS satisfacen solo una pequeña cantidad de sus necesidades
energéticas por esta vía. Las PLANTAS rara vez o nunca oxidan los aminoácidos para
obtener energía, ya que los carbohidratos producido a partir de CO2 y H2O en la
fotosíntesis es su única fuente. Las concentraciones de aminoácidos en los tejidos
vegetales se regulan cuidadosamente para cumplir con los requisitos de biosíntesis de
proteínas, ácidos nucleicos y otras moléculas necesarias para su crecimiento.
El catabolismo de aminoácidos ocurre en las plantas, pero su propósito es producir
metabolitos para otras vías biosintéticas.
▪ Los CARNÍVOROS consumen proteínas, extrayendo la mayoría de energía en los
aminoácidos.
Los aminoácidos pierden sus grupos amino para formar α-cetoácidos, los "esqueletos de
carbono" de los aminoácidos. Y se oxidan a CO2 y H2O o proporcionan unidades de 3-4 C
que pueden convertirse por gluconeogénesis en glucosa.
Las vías del catabolismo de los aminoácidos son bastante similares en la mayoría de los
organismos. Y al igual que en el catabolismo de carbohidratos y ácidos grasos, los procesos
de degradación de aminoácidos convergen en las vías catabólicas centrales, y los
esqueletos de carbono de la mayoría de los aminoácidos van hacia el CAC.
El ciclo celular es un evento muy complejo y bien regulado, esencial para la vida. Para su
regulación, contribuyen factores, como los cambios, modificaciones e interacciones en las
proteínas. Las proteínas con vidas medias más cortas en las células se secretan, mientras
que las de la mitocondria y el núcleo son de larga duración. El promedio de vida media de
las proteínas, suele ser entre 8,7 y 8,2 horas.
41
DIGESTIÓN CELULAR o RECAMBIO PROTEICO
Digestión de las PROTEÍNAS, en el interior celular, con la
finalidad de reciclar o degradar los aminoácidos de las mismas.
aminoácidos libres.
Esta proteólisis puede darse en los lisosomas (degrada moléculas) o en el citoplasma.
➢ PROTEÓLISIS LISOSÓMICA.
Ocurre en vesículas intracelulares especializadas, los lisosomas, cuyo interior está un pH
de 5,5 y contiene proteasas e hidrolasas, encargadas de la digestión de las proteínas.
La digestión puede ser:
• AUTOFÁGICA, procesa proteínas intracelulares como, por ejemplo, proteínas de
membrana, receptores hormonales o de ribosomas.
• HETOROFÁGICA, si actúa sobre proteínas extracelulares capturadas por endocitosis
como, por ejemplo, las LDL.
LISOSOMAS
Los lisosomas son unos orgánulos citoplásmicos muy heterogéneos, delimitados por una
membrana con proteínas transmembrana. Estos orgánulos tienen muchas enzimas hidrolítica
con pH ácido, el cual se mantiene mediante una bomba de protones en su membrana.
Una gran variedad de procesos celulares dependen de una buena función lisosomal, como
son: la homeostasis del colesterol, la inactivación de patógenos, la reparación de la
membrana plasmática, la remodelación ósea, etc.
Además, los lisosomas están implicados en la degradación de muchas moléculas para
formar proteínas, glucosaminoglicanos, esfingolípidos, etc.
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➢ PROTEÓLISIS CITOPLÁSMICA O NO LISOSÓMICA.
Esta degradación de proteínas tiene lugar a partir de:
• Proteasas dependientes de Ca2+ como la calpaína (proteólisis a pH neutro)
• Mediante una estructura especializada: proteasoma (complejo multienzimático).
En BACTERIAS, muchas proteínas son degradadas por uno de varios sistemas proteolíticos
que contienen ATPasas. Cada sistema se dirige a proteínas concretas.
La hidrólisis de ATP se usa para introducir la proteína diana a través de un poro hacia una
cámara proteolítica, desplegando la proteína en el proceso. Las proteínas se digieren
dentro de la cámara, y una vez se hayan reducido a pequeños péptidos inactivos, otras
proteasas completan su degradación.
Esta proteína se une a proteínas programadas para su destrucción a través de una vía
dependiente de ATP que incluye tres tipos diferentes de enzimas:
• ENZIMA ACTIVADORA E1.
GRUPO CARBOXILO TERMINAL de la ubiquitina + GRUPO SULFHIDRILO DE E1
mediante un enlace tioéster. Esta reacción que consume ATP
• ENZIMA CONJUGADORA E2: la UBIQUITINA ACTIVADA se transporta a un grupo
sulfhidrilo de E2, mediante la enzima conjugadora E2
• LIGASA E3. Cataliza la transferencia de la ubiquitina por su grupo amino desde la E2 a
la proteína diana.
E3 unido a las proteínas diana crea una cadena de moléculas de ubiquitina por unión al
grupo ɛ-amino de lisina 48 de una molécula de ubiquitina al carboxilato terminal de otra.
Una cadena de 4 o más moléculas de ubiquitina es eficaz para señalar la necesidad de
degradación.
OTRAS MARCAS:
• La N-acetilación también facilita la degradación
• Cajas de degradación de ciclinas
• Secuencias PEST [ prolina(P), glutámico (E), serina (S), treonina (T) ]
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PROTEASOMA
Las proteínas ubiquitinadas se degradan mediante un gran complejo multiproteíco
proteásico: proteasoma. Consta de dos copias, cada una de 32 subunidades diferentes.
Componentes clave del complejo 19S son 6ATPasas de un tipo llamado clase AAA.
La hidrólisis de ATP ayuda al complejo 19S a desplegar el sustrato e inducir cambios en el
núcleo catalítico 20S para que el sustrato pueda pasar al centro del complejo.
En las células hay complejos reguladores adicionales que pueden reemplazar la partícula
19S, pero no hidrolizan el ATP y no se unen a la ubiquitina.
Los sitios activos proteolíticos están en el interior del núcleo para proteger los sustratos
potenciales hasta que se dirigen al interior del núcleo.
Hay 3 tipos de sitios activos en las subunidades β, con una especificidad diferente, pero
todos utilizan una treonina N-terminal. El OH de treonina se convierte en un nucleófilo que
ataca los grupos carbonilo de los enlaces peptídicos para formar intermedios de acilenzima.
Los sustratos se degradan sin liberar intermedios de degradación, hasta que el sustrato se
reduce a péptidos de 7 a 9 residuos. Estos productos peptídicos se liberan del proteasoma
y otras proteasas celulares los degradan aún más para producir aminoácidos individuales.
La vía de ubiquitinación y el proteasoma cooperan para degradar proteínas no deseadas.
IMPLICACIONES CLÍNICAS
PARKINSON JUVENIL RECESIVO: proteínas no se degradan por una E3 defectuosa
SÍNDROME DE ANGELMAN: deleción o mutación del gen UBE3A que origina la ligasa E3
ocasionando un trastorno neurológico severo con discapacidad cognitiva, ausencia del habla,
descoordinación. Si se sobreexpresa la misma ligasa, el resultado es autismo.
RECAMBIO INADECUADO DE PROTEÍNAS puede provocar cáncer. Por ejemplo, el virus
del papiloma humano codifica una proteína que activa una enzima E3 específica.
INCAPACIDAD para degradar proteínas que activan la división celular (productos de los
oncogenes) puede provocar tumores. Una degradación demasiado rápida de las proteínas
que actúan como supresores de tumores puede tener el mismo efecto.
DEGRADACIÓN INEFICAZ o demasiado rápida de las proteínas celulares puede provocar
enfermedades renales, asma, trastornos neurodegenerativos como Alzheimer y Parkinson
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DEGRADACIÓN DE AMINOÁCIDOS
Los aminoácidos se usan como bloques de construcción para reacciones de biosíntesis de
proteínas. Sin embargo, cuando no se necesitan, se degradan a compuestos capaces de
entrar en la corriente metabólica general.
Para la separación del grupo amino, todos los aminoácidos sufren una reacción de
transaminación, que forma un nuevo aminoácido y un nuevo cetoácido. Finalmente, los
grupos amino se transfieren al a-cetoglutarato, formando glutamato: única molécula que
puede ser objeto de una desaminación oxidativa rápida.
TRANSAMINACIÓN y DESAMINACIÓN:
Separación del grupo amino → nuevo aminoácido + nuevo cetoácido
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Las reacciones catalizadas por las transaminasas son reversibles por lo que pueden
utilizarse para generar nuevos aminoácidos. La mayoría utilizan α-cetoglutarato como
aceptor del grupo amino, aunque difieren en su especificidad por el L-aminoácido.
El AMONÍACO es muy tóxico y los niveles en sangre están muy controlados. En tejidos,
como el cerebro, algunos procesos como la degradación de nucleótidos generan amoníaco
libre. En muchos animales, parte del amoníaco libre se convierte en un compuesto no
tóxico antes de exportarse de TEJIDOS EXTRAHEPÁTICOS → SANGRE → HÍGADO/RIÑON.
Para ello, el glutamato → L-glutamina.
El glutamato y el ATP reaccionan para formar γ-glutamil-P y ADP, que luego reacciona con
el amoníaco para producir glutamina y fosfato inorgánico
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La GLUTAMINA es una forma de transporte no tóxica de amoníaco. Presente en la sangre en
concentraciones mucho más altas que otros aminoácidos. Además, sirve como fuente de grupos amino
en una variedad de reacciones biosintéticas.
GLUTAMINA GLUTAMATO
Parte del glutamato producido en esta reacción puede ser procesado adicionalmente en el hígado por
la glutamato deshidrogenasa, liberando más NH3 y produciendo esqueletos de carbono para
combustible metabólico.
Sin embargo, la mayoría del glutamato entra en las reacciones de transaminación para la biosíntesis
de aminoácidos y otros procesos.
La ALANINA es una forma de transporte no tóxica de grupos amino al hígado, a través de una vía
llamada ciclo glucosa-alanina. Este ciclo permite transportar piruvato desde los tejidos al hígado
para que éste cree glucosa, y nitrógeno de forma segura por la sangre.
En el músculo y otros tejidos que degradan los aminoácidos como combustible, los grupos amino se
acumulan en forma de glutamato por transaminación que puede convertirse en glutamina para su
transporte al hígado o transferir su grupo α-amino al piruvato, un producto disponible de la
glucólisis muscular, mediante la alanina aminotransferasa.
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CICLO DE LA UREA
La UREA se compone de:
1 Carbono que proviene del HCO3- (derivado de la hidratación del CO2)
1 Nitrógeno, del amoniaco libre (donante del 1er grupo amino)
1 Nitrógeno, del aspartato (donante del 2º grupo amino)
48
➢ REGULACIÓN DEL CICLO DE LA UREA
La carbamoil-P sintetasa está regulada:
• Alostéricamente
• Modificación covalente.
▪ TRATAMIENTO
La deficiencia de argininosuccinasa se puede evitar en parte proporcionando un excedente
de arginina en la dieta y restringiendo la ingesta total de proteínas.
En el hígado, la arginina se divide en urea y ornitina que reacciona con carbamoil fosfato
para formar citrulina. Este intermedio del ciclo de la urea se condensa con aspartato para
producir argininosuccinato, que luego se excreta.
Así, 2 átomos de N2, uno del carbamoil fosfato y el otro del aspartato, se eliminan del
cuerpo por cada molécula de arginina proporcionada en la dieta. En esencia, el
argininosuccinato sustituye a la urea en la eliminación del nitrógeno del cuerpo.
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▪ RUTAS DE TRANSFORMACIÓN del ESQUELETO CARBONADO
El catabolismo de aminoácidos representa el 10%-15% de la producción de energía del
cuerpo humano. Estas vías no son tan activas como la glucólisis y la oxidación de ácidos
grasos. El flujo a través de estas rutas catabólicas varía mucho, dependiendo del equilibrio
entre los procesos biosintéticos y la disponibilidad de un aminoácido en particular.
Una vez eliminado el grupo amino, el siguiente paso es hidrolizar el resto del esqueleto
carbonado. Según el compuesto que se obtenga los aminoácidos:
• GLUCOGÉNICOS: los aminoácidos que, al degradarse, producen piruvato o
intermediarios del ciclo de Krebs (pueden transformarse a oxalacetato, y derivados a
la síntesis de glucosa a través de la gluconeogénesis). Ej: asparagina, metionina, valina
• CETOGÉNICOS: los aminoácidos que se convierten en acetil-CoA o acetoaceto. Pueden
desviarse a la formación de cuerpos cetónicos o pueden utilizarse para la síntesis de
lípidos o se liberan a la sangre para eliminarse. Ej: leucina, lisina
• Hay aminoácidos que pueden degradarse de AMBAS FORMAS: alanina, glicina, cisteína
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2 ESQUELETOS CARBONADOS producen OXALACETATO (asparagina y aspartato)
La enzima asparaginasa cataliza la hidrólisis de asparagina a aspartato, que se transamina
con α-cetoglutarato para producir glutamato y oxaloacetato.
El OXALACETATO → MALATO en el citosol y luego se transporta a la matriz mitocondrial
a través del transportador malato-α-cetoglutarato.
En las bacterias, el OXALACETATO → CAC
MAYORÍA del catabolismo de los aminoácidos ocurre en el hígado, los tres aminoácidos
con cadenas laterales ramificadas (leucina, isoleucina y valina) se oxidan como combustibles
en el tejido muscular, adiposo, renal y cerebral.
Estos tejidos extrahepáticos contienen una aminotransferasa, ausente en el hígado, que
actúa sobre los tres aminoácidos para producir los α-cetoácidos correspondientes.
El complejo de α-cetoácido deshidrogenasa de cadena ramificada cataliza luego la
descarboxilación oxidativa de los tres α-cetoácidos, en cada caso liberando el grupo
carboxilo como CO2 y produciendo acil-CoA.
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SÍNTESIS DE AMINOÁCIDOS
Los aminoácidos esenciales, sólo pueden ser sintetizados por bacterias y las plantas.
En la biosíntesis de los aminoácidos y de otros compuestos nitrogenados, la principal
dificultad es la fijación de los átomos de nitrógeno atmosférico (N 2) en estructuras
orgánicas. El nitrógeno, que forma el 80% de la composición del aire, no puede ser utilizado
por muchos organismos al ser tan estable e inerte para su uso en muchos procesos.
Sólo las bacterias y arqueas nitrificantes pueden asimilar el N2 del aire, mediante el
proceso de NITRIFICACIÓN: Reducción del nitrógeno atmosférico a compuestos
nitrogenados combinando el nitrógeno gaseoso con hidrógeno para formar amoníaco, que es
la principal fuente de nitrógeno de los aminoácidos.
TRES TIPOS DE BACTERIAS NITRIFICANTES:
• CIANOBACTERIAS. Incorporan N2 a la cadena alimentaria marina
• SIMBIONTES. Reduce el N2 que la planta utiliza, y a cambio la planta le da una fuente
de C para el crecimiento microbiano
• OTRAS BACTERIAS NO ASOCIADAS A PLANTAS y su fuente de nitrógeno la forman
los nitratos y nitritos del suelo.
MODIFICACIÓN COVALENTE
Por otra parte, está la inhibición por adenililación de Tyr397, cerca del sitio activo de la
enzima. Esta modificación covalente aumenta la sensibilidad a los inhibidores alostéricos y
la actividad disminuye a medida que se adenililan más subunidades.
Tanto la adenililación como la desadenililación son promovidas por la adenililtransferasa,
que forma parte de una cascada enzimática compleja que responde a los niveles de
glutamina, α-cetoglutarato, ATP y Pi.
La actividad de la adenililtransferasa se modula uniéndose a una proteína reguladora: PII, y
la actividad de la PII, a su vez, está regulada por modificación covalente (uridilación)
controlada por la uridililtransferasa.
La adenililtransferasa con PII uridilado estimula la desadenililación,
La adenilitransferasa con PII desuridilado estimula la adenililación
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TEMA 12 Y 13. NUCLEOTIDOS Y ÁCIDOS NUCLEICOS
Ácidos nucleicos descubiertos por FRIEDRICH MIESCHER.
Los ácidos nucleicos son biomoléculas orgánicas formadas por C, H, O, N y P. Además,
están formadas por los nucleótidos, unidos mediante enlaces fosfodiéster.
Son homobiopolímeros de nucleótidos.
• ÁCIDO FOSFÓRICO
El grupo fosfato es una molécula formada por 1 P, unido a 4 átomos de oxígeno.
Su fórmula química es PO43-. Este grupo de átomos se llama grupo fosfato cuando está
unido a una molécula que contenga carbono. Dan la característica ácida al ADN y ARN.
La pentosa y el grupo fosfato de cada nucleótido se unen para formar la columna vertebral
de los ácidos nucleicos. Cuando los nucleótidos NO están unidos a otros para formar ADN o
ARN, se unen a 2P formando el ATP o GTP, las cuales almacenan energía.
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FUNCIONES DE LOS NUCLEÓTIDOS
• ADENOSÍN NUCLEÓTIDOS
Actúan como intermediarios energéticos en las reacciones metabólicas en las que se libera
o consume energía, ya que los enlaces entre grupos fosfato acumulan o ceden energía,
mediante la formación o hidrólisis de un enlace: AMP, ADP y ATP. Otro ribonucleótidos
como GTP, UTP, TTP, CTP, GDP o CDP, están más limitados para transferir energía.
El ATP tiene un papel importante como moneda de intercambios energéticos.
Los fosfatos se unen entre sí, por enlaces anhidrido (reacción de condensación en la que
se libera H2O). Estos tipos de enlace pertenecen a un tipo de unión de alta energía ya que
almacenan más energía que otros enlaces covalentes.
Los grupos fosfato ceden protones adquiriendo cargas negativas que se repelen entre sí, y
para unirlos hay que vencer la fuerza de repulsión, entregando mayor cantidad de energía.
Por otra parte, cuando estas uniones se hidrolizan la energía es liberada.
• NICOTÍN NUCLEÓTIDOS
Son dinucleótidos formados por la unión de un ribonucleótido de adenina y uno de
nicotinamida. Contienen vitamina B3 y hay dos tipos:
- NAD+/NADH (Reacciones catabólicas)
- NADP+/NADPH (Reacciones anabólicas)
Actúan como coenzimas en las reacciones de óxido-reducción. Transportan hidrógeno de
unos sustratos a otros.
• FLAVÍN NUCLEÓTIDOS
Mono o dinucleótidos que contienen riboflavina (ribosa + flavina) o vitamina B2. Destacan:
- FMN/FMNH2. Formado por un nucleótido cuya base es la flavina
- FAD/FADH2. Formado por la unión de 2 nucleótidos: FMN y AMP
Actúan como coenzimas en las reacciones de oxido-reducción. Transportan hidrógeno de
unos sustratos a otros.
• COENZIMA A
Formado por el ADP unido a la vitamina B5 y a una cadena de mercaptoelilamina y -SH. La
parte activa es el grupo tiol (-SH), con un enlace alto en energía: CoA-SH
Interviene en la transferencia de grupos acetilo de unos sustratos a otros.
54
METABOLISMO DE NUCLEÓTIDOS
Los nucleótidos se forman continuamente en las células ya que las reservas no > 1% de la
cantidad necesaria para sintetizar el ADN (salvo de ATP).
Esta síntesis se realiza a través de dos rutas metabólicas distintas:
• RUTAS DE NOVO o BIOSÍNTESIS a partir de precursores simples
(aminoácidos, ribosa 5-fosfato, CO2 y NH3+).
Las bases libres (guanina, adenina, timina, citidina y uracilo) no son intermediarios de las
vías de síntesis, aunque sí pueden serlo en vías de recuperación. No se sintetizan y luego se
añade la ribosa (púricas).
El anillo de purina se consigue añadiendo átomos a la ribosa a lo largo del proceso.
El anillo de pirimidina se sintetiza como orotato unido a ribosa fosfato y luego se
convierte en los nucleótidos de pirimidina comunes.
• RUTAS DE RECUPERACIÓN, salvamento o reciclado: recicla las bases libres y los
nucleósidos liberados de degradación de los ácidos nucleicos procedentes del recambio
interno celular y la dieta
• PARTE COMÚN
El proceso comienza con el PRPP y los aminoácidos glicina, glutamina y aspartato,
necesarios para crear el núcleo de purina. Además, también se necesitan átomos de C.
En esta ruta de 10 pasos, ocurren transaminaciones y transferencias de glicina. En el
proceso, van interviniendo los compuestos necesarios para la síntesis de purina, hasta llegar
al último compuesto de esta parte de la síntesis, el FAICAR que al ciclarse, forma el anillo
de purina, dando el primer nucleótido de purina: el IMP
• PARTE RAMIFICADA
Al formarse el IMP, la ruta se bifurca para acabar en los dos nucleótidos derivados de
purina: AMP y GMP, pasando respectivamente en cada caso por compuestos intermedios:
adenilosuccinato y xantilato. Una vez obtenidos el AMP y GMP se pueden sintetizar el
resto de los nucleótidos de purina, incluidos los desoxirribonicleótidos, por acción de la
ribonucleótido reductasa
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SÍNTESIS DE NOVO DE PIRIMIDINAS
La síntesis de los nucleótidos de pirimidina difiere de la síntesis de los nucleótidos de
purinas en que lo que se sintetiza primero es la base nitrogenada (ácido orótico u orotato),
a partir de aspartato y carbamoíl-P.
CARBAMOIL-P + ASPARTATO → DIHIDROOROATO → ÁCIDO ORÓTICO
Aspartato transcarbomilasa
Una vez formado el ácido orótico, éste se une al PRPP para sintetizar un primer nucleótido:
orotidilato (OMP), el cual, por descarboxilación, forma el primero de los nucleótidos de
pirimidina: la uridina monofosfato (UMP). Este se fosforila a UTP, y este formará el CTP .
ÁCIDO ORÓTICO + PRPP = OMP → UMP → UTP → CTP
DEGRADACIÓN DE PURINAS
Ácido nucleico → oligonucleótidos → nucleótido → Pi + nucleósido → base + azúcar
Endonucleasas Fosfodiesterasas Nucleotidasas Nucleosidasas
Es una ruta OXIDATIVA:
Eliminación Pi → eliminación de ribosa → conversión a Xantina → transformación ácido úrico
Ácido úrico es el producto final del catabolismo de purinas en primates. Sin embargo,
estos excretan mucho más nitrógeno como urea (ciclo de la urea) que cómo ácido úrico.
DEGRADACIÓN DE PIRIMIDINAS
FORMACIÓN DE POLINUCLEÓTIDOS
ENLACE FOSFODIÉSTER
El enlace fosfodiéster es un enlace covalente que se produce entre un grupo fosfato
(H3PO4) y un grupo hidroxilo (–OH). Este tipo de enlace lo encontramos en:
▪ Fosfolípidos que forman la membrana celular
▪ Nucleótidos que forman los ácidos nucleicos ARN y ADN.
En el enlace fosfodiéster, se unen el OHC3 de la pentosa del 1er nucleótido y P-C5’ de la
pentosa del siguiente nucleótido. Se libera H2O y se forma un dinucleótido.
Las cadenas de ácidos nucleicos formadas, tienen un eje formado por la pentosa y el ácido
fosfórico y en este eje, unido a las pentosas, se posicionan las bases nitrogenadas.
Los ácidos nucleicos son moléculas “vectoriales” en las que cada polinucleótido contiene un
grupo fosfato sin enlazar en posición 5´, y un OH libre en posición 3´
Además, las secuencias de los polinucleótidos se representa en el sentido 5´ → 3´, que es,
además, el sentido de síntesis de los ácidos nucleicos. Los dos polinucleótidos presentes en
los seres vivos son el ARN y el ADN
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ESTRUCTURA DEL ADN
• ESTRUCTURA PRIMARIA
Secuencia lineal ordenada de nucleótidos de una cadena de ADN.
Contiene el mensaje biológico o información genética ya que existe un número casi infinito
de polinucleótidos por la posibilidad que hay de combinar cuatro nucleótidos diferentes.
En esta estructura reside la capacidad del ADN para contener la información necesaria
para la síntesis de proteínas. Cada grupo de 3 nucleótidos consecutivos (triplete o codón),
con sus bases nitrogenadas concretas, forman la unidad mínima de información y
codifican para un aminoácido concreto. La sucesión de codones en un orden concreto
determinan qué aminoácidos debe tener la proteína y en qué orden deben unirse:
La doble hélice se mantiene estable, por la formación de los puentes de hidrógenos entre
las bases asociadas a cada una de las dos hebras.
Para la formación de un enlace de hidrógeno: una base presenta un donador de hidrógenos
con un H con carga parcial positiva (-NH2 o -NH) y la otra base presenta un grupo
“aceptor” de hidrógenos con un átomo con carga parcial negativa. (C=O o N).
Los puentes de hidrógeno son uniones más débiles que los típicos enlaces químicos
covalentes como los que conectan los átomos en cada hebra de ADN, pero más fuertes que
interacciones hidrofóbas individuales, enlaces van der waals, etc.
Como los puentes de hidrógeno no son enlaces covalentes, pueden romperse y formarse
fácilmente. Por ello, las dos hebras de la doble hélice pueden separarse por fuerza
mecánica o por alta temperatura
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OTRAS CONFIGURACIONES
El ADN puede tener tres formas: ADN A, B (estructura de Watson y Crick) y Z
El ADN es una molécula muy flexible, que puede tener variaciones estructurales.
La forma B es la estructura más estable que puede adoptar un ADN. Las formas A y Z son
dos variantes estructurales.
El ADN A, predomina en disoluciones pobres en agua. Es una doble hélice dextrógira, pero
la hélice es más gruesa y 11 pares de bases por vuelta.
El ADN Z es una hélice levógira, con 12 pares de bases por vuelta y la estructura es más
delgada y alargada. Las cadenas del ADN adoptan un plegamiento en zigzag.
• ESTRUCTURA TERCIARIA
Consecuencia organizativa de la asociación del ADN con proteínas (cromatina)
En el caso de los virus, se pliegan con la ayuda de proteínas de bajo peso molecular o
proteínas de la cápsida. En ocasiones, puede utilizar las histonas del huésped para
organizarse en nucleosomas
Las histonas son proteínas que están muy conservadas evolutivamente entre los eucariotas.
Su masa molecular es baja, con un alto contenido de lisina y arginina. Además, se unen a los
grupos fosfatos del ADN, y a menudo son modificadas por metilaciones, acetilaciones,
fosforilaciones, o ADP-ribosilaciones.
En eucariotas, el ADN se organiza en la cromatina: sustancia de las células eucariotas
formada por histonas, con el ADN y el ARN, cuya función es darle forma al cromosoma
para que se integre al núcleo de la célula. Hay dos modelos:
B. ESTRUCTURA CRISTALINA
Asociación de ADN con protaminas, proteínas básicas (más que las histonas), que tienen
mayor afinidad por el ADN que las histonas, por lo que la estructura aparece más
empaquetada. Aparece en el núcleo de los espermatozoides.
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• ESTRUCTURA CUATERNARIA
La organización del ADN en una estructura cuaternaria, origina la fibra de cromatina de
300 A o Solenoide: Es el enrollamiento de la fibra de 100 A condensada sobre sí misma.
Cada vuelta tiene 6 nucleosomas con 6 histonas H1 (forman el eje de la hélice).
La fibra de 300 A, forma una serie de bucles que estabilizan proteínas del eje del
cromosoma. Algunos consideran que en el cromosoma existe un eje de proteína no histónico,
llamado armazón central o andamio, sobre el que se anclan los bucles. Los dominios
estructurales en forma de bucles forman el 3 nivel de empaquetamiento. 6 bucles
formarían una roseta, y 30 rosetas seguidas en espiral, un rodillo (4 nivel). El 5 y último
nivel, el cromosoma estaría formado por la sucesión de rodillos.
▪ EUCROMATINA.
Conformación más laxa y asociada a ARN polimerasas que permite la expresión
genética. Es la forma más abundante durante la interfase superando el 90% de toda la
cromatina.
▪ HETEROCROMATINA.
Conformación más compacta que NO permite la expresión genética. Se distinguen: la
constitutiva: nunca se expresa, y la facultativa, puede pasar a eucromatina y
expresarse.
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ESTRUCTURA DEL ARN
Es el ácido nucleico más abundante en la célula. Una célula contiene 10 veces más ARN
que ADN. En la posición 2´ del anillo de la ribosa hay un OH libre que hace que el ARN es
inestable, de forma que en una disolución acuosa se hidroliza fácilmente.
En la mayoría de los casos, es un polímero monocatenario pero también puede presentar
zonas en su secuencia con apareamientos intracatenarios. Parece probable que el ARN
fuese el primer biopolímero que apareció en la corteza terrestre durante la evolución.
TIPOS DE ARN
▪ ARN MENSAJERO (ARNm)
Es una molécula corta y lineal de hasta 5000 nucleótidos, de vida corta, y con sólo
estructura primaria. El ARNm es el portador de la información genética del ADN, se
asocia a los ribosomas en el citoplasma y dirige la síntesis de proteínas.
En procariotas, el ARNm no se procesa.
En eucariotas, el ARNm se origina a partir del ARN heterogéneo nuclear que a su vez, se
forma por transcripción directa, catalizada por la ARN polimerasa, de un fragmento de
ADN que contiene información genética.
Existen 60 tipos que se sintetizan en el nucleoplasma por una ARN polimerasa III y viajan
hasta el citoplasma (en eucariotas). En el anticodón hay tripletes, complementarios de los
codones del ARNm, que determinan que aminoácidos y en qué orden deben situarse en la
proteína. Su función es captar aminoácidos específicos en el citoplasma y transportarlos
hasta los ribosomas, donde se sintetizan las proteínas.
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TEMA 14. REPLICACIÓN Y TRANSCRIPCIÓN DEL ADN
DOGMA CENTRAL DE LA BIOLOGÍA
El flujo de información genética es el dogma central de la biología. Cuando los genes se
expresan, la información genética codificada en el ADN se transfiere al ARN.
Este dogma, además, establece una equivalencia entre los genes (unidades de información
genética que residen en el ADN) y las proteínas (unidad funcional para la que contienen
información)
El vínculo descubierto entre los genes y las enzimas se llamó hipótesis "un gen, una
enzima". Esta hipótesis ha sufrido actualizaciones:
▪ Algunos genes codifican proteínas que no son enzimas. En las células existen proteínas
que no son enzimas y están codificadas por genes (p. ej. proteína ribosomales…)
▪ Algunos genes codifican una subunidad de una proteína, no una proteína entera. Un gen
codifica un polipéptido, es decir una cadena de aminoácidos. Algunas proteínas se
conforman de varios polipéptidos de distintos genes.
▪ Algunos genes codifican moléculas de ARN funcional.
Aunque el concepto de "un gen, una enzima" no es del todo preciso, su idea central -que un
gen especifica una proteína en una relación uno a uno- todavía es útil.
Los EUCARIOTAS: Los dos primeros pasos del dogma central (la replicación y la
transcripción) ocurren en el núcleo. Debido a que los ribosomas no están en el núcleo, los
ARNm y otros ARN se transportan al exterior.
Los PROCARIOTAS. Los ARNm no tienen que exportarse desde un orgánulo para
traducirse. La transcripción y la traducción puede ocurrir A LA VEZ en un proceso conocido
como transcripción y traducción acopladas. Durante este proceso, un ribosoma inicia la
traducción de un ARNm antes de que la ARN polimerasa haya terminado de sintetizarla.
Esto permite un crecimiento rápido de las células y su rápida adaptación a los cambios.
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CONCEPTO DE GEN
GEN es un fragmento de ADN que codifica un producto determinado, puede ser una cadena
polipeptídica (proteína) o un ARN funcional (ARNt, ARNr, ARNsn…).
Los genes determinan la naturaleza y el orden en el que se unen los aminoácidos para
formar una proteína, o los nucleótidos de un ARN funcional.
El GEN es una unidad de información y actúa como una unidad hereditaria ya que, cuando la
célula se divide, los genes transmiten su información a la descendencia. Desde el punto de
vista molecular el gen funciona como una unidad de transcripción.
Cada gen puede existir en varias formas llamadas ALELOS.
A partir de un mismo gen surgen diferentes alelos por mutaciones. Los sitios de un
cromosoma ocupados por un gen se llaman LOCUS (singular) o LOCI (plural).
El conjunto de genes o material genético de un organismo forma el GENOMA
Los genes de las EUCARIOTAS tienen INTRONES, secuencias de ADN sin información
para la cadena polipeptídica que separan los EXONES que sí la poseen.
En VIRUS se descubrió que una secuencia de nucleótidos puede contener dos genes, según
se empiece a leer por el 1 nucleótido o por el 2 nucleótido. Se llaman genes solapados.
En BACTERIAS se han descrito dos genes codificantes para proteínas diferentes en la
misma región de ADN, pero situados de forma antiparalela cada una, en una de las hebras
de ADN.
ESTRUCTURA DE UN GEN
• una región PROMOTORA (o reguladora)
• inicio de transcripción
• fin de la transcripción
• dos zonas que se transcriben pero no se traducen (UTR).
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Los ELEMENTOS TRANSPONIBLES son secuencias de ADN que se insertan en otras
moléculas de ADN pero puede moverse de un sitio en la molécula de ADN a otro, ya sea
dentro de la misma molécula o en una molécula de ADN diferente.
Están en procariotas y eucariotas y juegan papeles importantes en la variación genética.
Las células que están en el ciclo celular (en división) se llaman proliferantes y las que se
encuentran en fase G0 (no se dividen), quiescentes.
• REPLICACIÓN ES SEMICONSERVATIVA
Modelo propuesto por Watson y Crick. Las dos hebras del ADN progenitor se separan y
actúan como molde o patrón para la síntesis de dos nuevas hebras cuya secuencia de
bases es complementaria a la hebra molde. De esta manera, cada una de las cadenas hijas
estará formada por una hebra del ADN progenitor y otra de nueva formación.
• REPLICACIÓN ES BIDIRECCIONAL
Comienza en zonas del ADN donde existen secuencias específicas de nucleótidos, que son
reconocidas por las enzimas, y que determinan la señal de inicio u origen de replicación
En dichas regiones, comienza la separación de las dos hebras del ADN, originando una
burbuja de replicación, con dos horquillas de replicación. Hay casos de replicación
unidireccional en el ADN mitocondrial, plásmidos bacterianos y virus de cadena simple.
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• REPLICACIÓN ES SEMIDISCONTINUA
Una de las cadenas, la que copia la hebra 3´→ 5´, se sintetiza de manera continua en
sentido 5´→ 3´ siguiendo el avance de la horquilla de replicación. Se llama hebra
conductora o adelantada
La otra hebra, cadena retrasada o retardada, que copia la hebra patrón 5´→ 3´, se
sintetiza en sentido contrario al avance de la horquilla de replicación. Para que sea posible,
la cadena retardada se origina de forma discontinua, en forma de cortos fragmentos de
ADN (fragmentos de Okazaki)
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MECANISMO DE REPLICACIÓN DEL ADN
Ocurre una sola vez en cada generación. Se pueden distinguir
d. TERMINACIÓN de la replicación
En procariotas, con 1 cromosoma circular, las dos horquillas de la replicación están en el
extremo contrario al origen, lo que provoca la desorganización de los replisomas y supone la
conclusión del proceso de replicación.
En eucariotas se produce parecido, pero al fusionarse las burbujas de replicación
adyacentes.
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FIDELIDAD DE LA REPLICACIÓN/REPARACIÓN DEL ADN:
La replicación es un proceso extraordinariamente fiel: cuando una célula se divide da lugar
a dos células hijas con un material genético IDÉNTICO entre ellas y al de la progenitora.
Si no fuera así se pondría en peligro la supervivencia de la célula e, incluso, de la especie.
Esto se consigue gracias a:
• Las enzimas tienen mucha especificidad en cuanto a la correspondencia entre el
nucleótido que copian de la cadena molde y el dNTP que utilizan como sustrato para su
incorporación en la cadena naciente mediante la formación de un enlace fosfoéster.
• Una vez incorporado el nucleótido a la cadena naciente, antes del desplazamiento de la
ADN polimerasa sobre el molde, transcurre un tiempo (segunda “lectura”) de forma
que, si el nucleótido incorporado no ha sido el correcto, una actividad exonucleásica lo
elimina.
TIPO DE MUTACIONES
- GÉNICAS. Sustitución, deleción o adicción de bases
- CROMOSÓMICAS: Deleción, duplicación, inversión o translocación cromosómica
- GENÓMICAS:
Euploidía: Afectan al número normal de dotaciones cromosómicas.
Aneuploidía. Afectan al número de alguno de los cromosomas.
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TRANSCRIPCIÓN DEL ADN
La TRANSCRIPCIÓN del ADN es el primer proceso de la expresión génica. Se transfiere
la información de la secuencia del ADN hacia la secuencia de proteína utilizando ARN como
intermediarios y proteínas.
Durante la transcripción genética, las secuencias de ADN son copiadas a ARN mediante
la ARN polimerasa encargada de sintetizar un ARN mensajero que es copia de la
información del ADN.
En cada gen, sólo una de las dos cadenas que posee el ADN se transcribe, es decir, la
transcripción es un proceso asimétrico.
REGIÓN ESTRUCTURAL
5´ UTR: El punto de iniciación de la transcripción se sitúa 100-200 nucleótidos por
delante del primer triplete codificante (ATG)
REGIÓN CODIFICADORA: Parte del gen que contiene la información para la síntesis de la
proteína (o para los nucleótidos del ARN funcional). En eucariotas, hay fragmentos de ADN
que no contienen información, los intrones, y fragmentos que sí la tienen, los exones.
Considerando la hebra en el sentido 5´- 3´, esta región se inicia con el triplete ATG y
acaba en TAA, TAG o TGA; tripletes -codones- que se llaman de paro o secuencias stop
(no codifican para ningún aminoácido)
3´ UTR: La región terminadora marca el final del gen y sirve de señal para la disgregación
del complejo de transcripción, y la terminación de la transcripción.
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OPERÓN:
Es una unidad genética funcional formada por un grupo de genes capaces de ejercer una
regulación de su propia expresión por medio de los sustratos con los que interactúan las
proteínas codificadas por sus genes. Típico de bacterias.
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MECANISMO DE TRANSCRIPCIÓN DEL ADN
La transcripción en eucariotas se realiza en el núcleo. Sólo se transcribe el ADN que está
en forma de eucromatina, formada por hebras de 100 Å. Los transcritos primarios de ARN
son modificados una vez sintetizados a través del proceso de maduración.
Además de las ARNp intervienen proteínas: los factores de transcripción (basales y
específicos) y co-activadores (intervienen en el andamiaje y mantenimiento del complejo
de transcripción).
• INICIACIÓN (Eucariotas)
Durante el inicio de la transcripción NO se necesita un cebador para crear la nueva
cadena. Las ARN polimerasas son capaces de iniciar la síntesis de novo de una cadena de
ARN. Se unen a secuencias específicas en el ADN, promotores, que dirigen la transcripción
de genes.
Antes del inicio de la transcripción en EUCARIOTAS: factores basales + promotores.
Estos se localizan en los extremos 5' de los genes, antes del comienzo de la zona
codificadora. Los factores basales de transcripción se unen a ellos mediante fuerzas de
Van der Waals y puentes de hidrógeno.
Sobre la caja TATA se fija una proteína de unión (TBP) junto con otros factores de
transcripción (TFIIA+TFIIB+TFIID). Luego se une el factor TFIIF, la ARN polimerasa y, al
final, el TFIIE. Todo ello forma un complejo «complejo de preiniciación cerrado» o PIC.
Cuando se une factor de transcripción TFIIH, el ADN se desnaturaliza parcialmente y da
lugar al «complejo de iniciación abierto».
• INICIACIÓN (Procariotas):
En BACTERIAS, los promotores son reconocidos por el factor sigma, y una vez que la ARN
polimerasa se ha unido a un promotor, la transcripción puede continuar.
En este proceso, la hélice de ADN en el sitio del promotor es abierta por ARN polimerasa,
y a medida que la polimerasa se mueve, desenrolla el ADN en segmentos cortos para
exponer el ADN a transcribir.
Como algunos genes residen en una hebra de ADN mientras que otros genes residen en la
otra hebra de ADN, los promotores están presentes en ambas cadenas; como resultado,
transcripción ocurre en direcciones opuestas en las dos cadenas diferentes de ADN.
• ELONGACIÓN
La ARN polimerasa cataliza la elongación de cadena del ARN añadiendo nucleótidos al
extremo 3-OH de la cadena naciente (dirección de síntesis 5´-> 3´) a partir de los
correspondientes NTP y de acuerdo con el orden que dicta la cadena de ADN molde.
En el centro activo de la ARN polimerasa quedan posicionados:
• el nucleótido correspondiente de la cadena molde
• el último nucleótido de la cadena naciente (extremo 3´-OH)
• el NTP entrante
Cuando el ribonucleótido trifosfato entrante forma los puentes de hidrógeno (A=U, G≡C), la
ARN polimerasa cataliza la formación del enlace fosfoéster y se libera PPi.
La ARN polimerasa mantiene abierta en la doble hebra de ADN una burbuja de
transcripción de 20 nucleótidos. A medida que se desplaza, se produce la desnaturalización
o apertura por la zona de avance y la renaturalización o cierre por la posterior.
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• TERMINACIÓN
Una vez que la elongación se ha completado, el complejo de transcripción debe
desensamblarse. La terminación es poco conocida en eucariotas.
PROCESAMIENTO ARN
Todos los ARN se transcriben de sus genes y requieren un procesamiento adicional para
llegar a ser maduro y funcional.
Los genes varían según el número y la longitud de los intrones, pero un gen típico de los
mamíferos tiene de 7 a 8 exones repartidos. Los exones: cortos, y los intrones: largos
• INTRÓN es una región del ADN que forma parte de la transcripción primaria de ARN.
Son eliminados del transcrito maduro, previamente a su traducción
• EXÓN es la región de un gen que NO es separada durante el proceso de corte y
empalme y, por tanto, se mantienen en el ARNm maduro.
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TEMA 15. TRADUCCIÓN DEL ADN
TRADUCCIÓN
CÓDIGO GENÉTICO: es el conjunto de reglas que determinan cómo la secuencia de
nucleótidos de una molécula de ARNm especifica la secuencia de aminoácidos de un
polipéptido.
Dado que existen 20 aminoácidos diferentes y solo 4 nucleótidos en el ADN, la
correspondencia no puede ser 1 = 1.
Sólo hay un tipo de tripletes que no codifican aminoácidos, los indicativos de terminación:
UAG, UAA, UGA. Todos los demás tripletes codifican, al menos, para un aminoácido.
La señal (triplete o codón) de iniciación es siempre la misma, AUG codifica para el
aminoácido metionina, en consecuencia, todas las proteínas empiezan por este aminoácido
(extremo N-terminal).
SÍNTESIS DE PROTEÍNAS
A través de la traducción, la información contenida en el ARNm es concretada en la
síntesis de una proteína.
La especificidad funcional de los polipéptidos reside en la secuencia lineal de sus
aminoácidos que determina su estructura primaria, secundaria y terciaria.
El ordenamiento lineal de aminoácidos de un polipéptido depende de la secuencia lineal de
ribonucleótidos en el ARN que a su vez está determinada por la secuencia lineal de
desoxiribonucleótidos del ADN.
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ARNt
Los aminoácidos por sí solos NO pueden reconocer los tripletes del ARNm, por lo que se
unen a un ARN de pequeño tamaño: ARN adaptador, ARN soluble o ARN transferente
(70-90 nucleótidos; coeficiente de sedimentación 4S).
RIBOSOMAS
Se establece la correspondencia entre los tripletes del ARNm (codones) y los
complementarios (anticodones) de los ARNt cargados con su aminoácido específico y
permite la formación de los enlaces peptídicos entre los aminoácidos para originar las
proteínas
Los genes que codifican para los ARNr 28S, 5,8S y 18S de las subunidades grande y
pequeña de los ribosomas eucarióticos se localizan en regiones concretas de los
cromosomas, organizadores nucleolares (NOR) en las que hay centenares de copias
repetidas en tándem de estos genes. La molécula transcrita precursora de los ARNr tiene
un tamaño mayor (45S) y es sometida a procesamiento. El gen que llevan la información
para el ARN5S están en otra región cromosómicas diferente al NOR.
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MECANISMO DE TRADUCCIÓN. SÍNTESIS DE PROTEÍNAS
1. ACTIVACIÓN DE LOS AA Y FORMACIÓN DE LOS COMPLEJOS DE
TRANSFERENCIA: El grupo carboxilo del aa se activa y se une al ARNt
La activación de los aminoácidos para formar los complejos de transferencia es el paso
previo necesario para que pueda comenzar la traducción.
Consiste en la unión de cada aminoácido a su ARNt específico mediante la aminoacil-
ARNt sintetasa y ATP
Ésta es una reacción de condensación entre el -OH del extremo 3' del ARNt y el -OH del
grupo carboxilo del aminoácido. Todos los ARNt en su extremo 3' contienen la secuencia
5'-CCA-3’.
Las aminoacil-ARNt-sintetasas tienen tres sitios distintos:
• uno para el reconocimiento del aminoácido
• otro para el ARNt (se une a través del lazo dihidrouracilo)
• otro para el ATP
Existe (al menos) una aminoacil-ARNt-sintetasa diferente por cada ARNt distinto.
• FASE 3. Unión de la subunidad ribosomal 50S favorecida por la hidrólisis del GTP
unido a IF2 catalizada por una proteína ribosomal. Una vez unidas, ambas subunidades
se sueltan o se disocian los factores IF2 e IF3. La función de IF1 no se conoce con
exactitud, aunque se cree que facilita la acción del IF3.
El complejo ribosómico de iniciación queda conformado con ARNt-formilmetionina
posicionado en el sitio P, interactuando a través de su anticodón con el primer codón
(AUG) del ARNm. El sitio A, está libre y en él está posicionado el 2º codón del ARNm.
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En PROCARIOTAS.
El lugar de unión del mensajero al ribosoma para comenzar la traducción se define por la
existencia de unas secuencias cortas que preceden a los codones de iniciación y que son
complementarias de secuencias del extremo 3' del ARNr 16S de la subunidad pequeña
(30S) de los ribosomas. Estas secuencias se llaman secuencias Shine-Dalgarno.
En EUCARIOTAS
NO se han detectado estas secuencias en el ARNr 18S y la traducción comienza por el
triplete AUG más cercano al extremo 5' del ARNm. Se ha propuesto que el ribosoma se
une al ARNm por su extremo 5'-cap y éste se movería hacia el extremo 3' hasta encontrar
el primer AUG.
• FASE 2. La liberación del complejo EF-Tu-GDP del ribosoma está mediada por la
unión del factor de elongación EF-Ts que también interviene en la regeneración y
activación del factor EF-Tu. La hidrólisis del GTP del complejo EF-Tu-GDP sirve de
cronómetro molecular, de forma que hasta que esta no se produce, el aminoacil-ARNt
puede abandonar el sitio A
• FASE 4. Paso promovido por la intervención del factor EF-G-GTP: la hidrólisis del GTP
permite que el ribosoma avance un codón sobre el ARNm en la dirección 5´ 3´ (se
transloca). El ARNt descargado, que estaba en el SITIO P, se libera y al moverse el
ribosoma, el peptidil-ARNt recién formado, que estaba en el SITIO A , pasa a ocupar
el SITIO P.
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4. TERMINACIÓN y reciclado de ribosomas: Se completa la cadena peptídica
y se liberan los ribosomas.
No hay ningún ARNt que reconozca a los tripletes de terminación, son los factores de
terminación o liberación (RF1, RF2 y RF3) los que reconocen los codones de STOP.
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