Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
MTA3
Ідентифікатори
Символи
MTA3 , metastasis associated 1 family member 3
Зовнішні ІД
OMIM : 609050 MGI: 2151172 HomoloGene: 14282 GeneCards: MTA3
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • sequence-specific DNA binding • DNA binding • zinc ion binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • histone deacetylase activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0032403 protein-containing complex binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001106 transcription corepressor activity • histone deacetylase binding
Клітинна компонента
• внутрішньоклітинна мембранна органела • клітинне ядро • нуклеоплазма • цитоплазма • NuRD complex
Біологічний процес
• GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • histone deacetylation • positive regulation of cell population proliferation • positive regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of nucleic acid-templated transcription
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 2: 42.49 – 42.76 Mb
Хр. 17: 84.01 – 84.13 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
MTA3 (англ. Metastasis associated 1 family member 3 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 594 амінокислот , а молекулярна маса — 67 504[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAANMYRVGD YVYFENSSSN PYLIRRIEEL NKTASGNVEA KVVCFYRRRD
ISNTLIMLAD KHAKEIEEES ETTVEADLTD KQKHQLKHRE LFLSRQYESL
PATHIRGKCS VALLNETESV LSYLDKEDTF FYSLVYDPSL KTLLADKGEI
RVGPRYQADI PEMLLEGESD EREQSKLEVK VWDPNSPLTD RQIDQFLVVA
RAVGTFARAL DCSSSVRQPS LHMSAAAASR DITLFHAMDT LYRHSYDLSS
AISVLVPLGG PVLCRDEMEE WSASEASLFE EALEKYGKDF NDIRQDFLPW
KSLTSIIEYY YMWKTTDRYV QQKRLKAAEA ESKLKQVYIP TYSKPNPNQI
STSNGKPGAV NGAVGTTFQP QNPLLGRACE SCYATQSHQW YSWGPPNMQC
RLCAICWLYW KKYGGLKMPT QSEEEKLSPS PTTEDPRVRS HVSRQAMQGM
PVRNTGSPKS AVKTRQAFFL HTTYFTKFAR QVCKNTLRLR QAARRPFVAI
NYAAIRAEYA DRHAELSGSP LKSKSTRKPL ACIIGYLEIH PAKKPNVIRS
TPSLQTPTTK RMLTTPNHTS LSILGKRNYS HHNGLDELTC CVSD
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів .
Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші