NR1H2

NR1H2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1P8D, 1PQ6, 1PQ9, 1PQC, 1UPV, 1UPW, 3KFC, 3L0E, 4DK7, 4DK8, 4RAK, 5HJP, 4NQA, 5I4V,%%s4NQA
Ідентифікатори
Символи	NR1H2, LXR-b, LXRB, NER, NER-I, RIP15, UNR, Liver X receptor beta, nuclear receptor subfamily 1 group H member 2
Зовнішні ІД	OMIM: 600380 MGI: 1352463 HomoloGene: 21397 GeneCards: NR1H2
Реагує на сполуку
(25R)-cholest-5-ene-3β,26-diol, desmosterol
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • ATPase binding • zinc ion binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • зв'язування з іоном металу • retinoid X receptor binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • steroid hormone receptor activity • apolipoprotein A-I receptor binding • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • transcription factor binding • nuclear receptor coactivator activity • signaling receptor activity Клітинна компонента • цитоплазма • нуклеоплазма • клітинне ядро • RNA polymerase II transcription regulator complex Біологічний процес • positive regulation of high-density lipoprotein particle assembly • negative regulation of proteolysis • positive regulation of triglyceride biosynthetic process • GO:0051247, GO:0051200 positive regulation of protein metabolic process • negative regulation of interferon-gamma-mediated signaling pathway • positive regulation of cholesterol transport • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cellular lipid metabolic process • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of secretion of lysosomal enzymes • positive regulation of lipid storage • positive regulation of lipoprotein lipase activity • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of fatty acid biosynthetic process • negative regulation of gene expression • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of cholesterol storage • negative regulation of pinocytosis • GO:1901313 positive regulation of gene expression • retinoic acid receptor signaling pathway • positive regulation of cholesterol efflux • positive regulation of pancreatic juice secretion • lipid homeostasis • negative regulation of lipid transport • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of macrophage derived foam cell differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • steroid hormone mediated signaling pathway • cholesterol homeostasis • lipid metabolism • multicellular organism development • диференціація клітин • cellular response to lipopolysaccharide • negative regulation of cold-induced thermogenesis • intracellular receptor signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7376	22260
Ensembl	ENSG00000131408	ENSMUSG00000060601
UniProt	P55055	Q60644
RefSeq (мРНК)	NM_007121 NM_001256647	NM_001285517 NM_001285518 NM_001285519 NM_009473
RefSeq (білок)	NP_001243576 NP_009052 NP_009052.3	NP_001272446 NP_001272447 NP_001272448 NP_033499
Локус (UCSC)	Хр. 19: 50.33 – 50.38 Mb	Хр. 7: 44.2 – 44.2 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NR1H2 (англ. Nuclear receptor subfamily 1 group H member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 460 амінокислот, а молекулярна маса — 50 974.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSPTTSSLD		TPLPGNGPPQ		PGAPSSSPTV		KEEGPEPWPG		GPDPDVPGTD
EASSACSTDW		VIPDPEEEPE		RKRKKGPAPK		MLGHELCRVC		GDKASGFHYN
VLSCEGCKGF		FRRSVVRGGA		RRYACRGGGT		CQMDAFMRRK		CQQCRLRKCK
EAGMREQCVL		SEEQIRKKKI		RKQQQESQSQ		SQSPVGPQGS		SSSASGPGAS
PGGSEAGSQG		SGEGEGVQLT		AAQELMIQQL		VAAQLQCNKR		SFSDQPKVTP
WPLGADPQSR		DARQQRFAHF		TELAIISVQE		IVDFAKQVPG		FLQLGREDQI
ALLKASTIEI		MLLETARRYN		HETECITFLK		DFTYSKDDFH		RAGLQVEFIN
PIFEFSRAMR		RLGLDDAEYA		LLIAINIFSA		DRPNVQEPGR		VEALQQPYVE
ALLSYTRIKR		PQDQLRFPRM		LMKLVSLRTL		SSVHSEQVFA		LRLQDKKLPP
LLSEIWDVHE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 19