TBP

TBP
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1TGH, 1C9B, 1JFI, 1NVP, 4ROC, 4ROE, 4ROD, 5IY9, 5IYA, 5FUR, 5IYC, 5IYB, 5IY7, 5IY8, 5IYD, 5IY6
Ідентифікатори
Символи	TBP, GTF2D, GTF2D1, HDL4, SCA17, TFIID, TATA-box binding protein, TATA-binding protein, TBP1
Зовнішні ІД	OMIM: 600075 MGI: 101838 HomoloGene: 2404 GeneCards: TBP
Пов'язані генетичні захворювання
spinocerebellar ataxia type 17
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • enzyme binding • TFIIB-class transcription factor binding • aryl hydrocarbon receptor binding • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase III general transcription initiation factor activity • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • RNA polymerase III transcription regulatory region sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • transcription factor TFIID complex • male pronucleus • female pronucleus • нуклеоплазма • transcription factor TFIIA complex • Пронуклеус • клітинне ядро • transcription preinitiation complex • GO:0009327 protein-containing complex • transcription factor TFIIIB complex • transcription regulator complex Біологічний процес • termination of RNA polymerase I transcription • epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription initiation from RNA polymerase I promoter • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • Сперматогенез • DNA-templated transcription, initiation • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • snRNA transcription by RNA polymerase II • regulation of signal transduction by p53 class mediator • GO:0022415 viral process • regulation of transcription by RNA polymerase III • transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase III • RNA polymerase II preinitiation complex assembly • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • RNA polymerase III preinitiation complex assembly • GO:0001183 transcription elongation from RNA polymerase I promoter Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6908	21374
Ensembl	ENSG00000112592	ENSMUSG00000014767
UniProt	P20226	P29037
RefSeq (мРНК)	NM_003194 NM_001172085	NM_013684
RefSeq (білок)	NP_001165556 NP_003185	NP_038712
Локус (UCSC)	Хр. 6: 170.55 – 170.57 Mb	Хр. 17: 15.72 – 15.75 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TBP (англ. TATA-box binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 339 амінокислот, а молекулярна маса — 37 698.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDQNNSLPPY		AQGLASPQGA		MTPGIPIFSP		MMPYGTGLTP		QPIQNTNSLS
ILEEQQRQQQ		QQQQQQQQQQ		QQQQQQQQQQ		QQQQQQQQQQ		QQQQQAVAAA
AVQQSTSQQA		TQGTSGQAPQ		LFHSQTLTTA		PLPGTTPLYP		SPMTPMTPIT
PATPASESSG		IVPQLQNIVS		TVNLGCKLDL		KTIALRARNA		EYNPKRFAAV
IMRIREPRTT		ALIFSSGKMV		CTGAKSEEQS		RLAARKYARV		VQKLGFPAKF
LDFKIQNMVG		SCDVKFPIRL		EGLVLTHQQF		SSYEPELFPG		LIYRMIKPRI
VLLIFVSGKV		VLTGAKVRAE		IYEAFENIYP		ILKGFRKTT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Peterson M.G., Tanese N., Pugh B.F., Tjian R. (1990). Functional domains and upstream activation properties of cloned human TATA binding protein. Science. 248: 1625—1630. PMID 2363050 DOI:10.1126/science.2363050
• Geisberg J.V., Lee W.S., Berk A.J., Ricciardi R.P. (1994). The zinc finger region of the adenovirus E1A transactivating domain complexes with the TATA box binding protein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 2488—2492. PMID 8146144 DOI:10.1073/pnas.91.7.2488
• Veschambre P., Simard P., Jalinot P. (1995). Evidence for functional interaction between the HIV-1 Tat transactivator and the TATA box binding protein in vivo. J. Mol. Biol. 250: 169—180. PMID 7608968 DOI:10.1006/jmbi.1995.0368
• LeRoy G., Orphanides G., Lane W.S., Reinberg D. (1998). Requirement of RSF and FACT for transcription of chromatin templates in vitro. Science. 282: 1900—1904. PMID 9836642 DOI:10.1126/science.282.5395.1900
• Yuan C.X., Gurley W.B. (2000). Potential targets for HSF1 within the preinitiation complex. Cell Stress Chaperones. 5: 229—242. PMID 11005381 DOI:10.1379/1466-1268(2000)005<0229:PTFHWT>2.0.CO;2
• Friedrich J.K., Panov K.I., Cabart P., Russell J., Zomerdijk J.C.B.M. (2005). TBP-TAF complex SL1 directs RNA polymerase I pre-initiation complex formation and stabilizes upstream binding factor at the rDNA promoter. J. Biol. Chem. 280: 29551—29558. PMID 15970593 DOI:10.1074/jbc.M501595200

Див. також

• Хромосома 6