Programa del curso IB-3601

Bioquímica

Escuela de Biología
Carrera/programa de Ingeniería en Biotecnología (IBio)

[Última revisión de la plantilla: 18 de octubre de 2021 por A. Fedorov]

 I parte: Aspectos relativos al plan de estudios

1 Datos generales
Nombre del curso: Bioquímica
Código: IB-3601

Tipo de curso: Teórico

Semipresencial (60% de las sesiones impartidas de forma
Tipo de grupo:
virtual)
Modalidad: Semestral

Electivo o no: Curso no electivo

Nº de créditos: 3
Nº horas de clase por
3
semana:
Nº horas extraclase por
6
semana:
% de las áreas curriculares: No aplica
Ubicación en el plan de
Curso del 4to semestre de la carrera IBio
estudios:
QU2403 Química orgánica y QU2404 Laboratorio de
Requisitos:
Química orgánica
Correquisitos: Laboratorio de Bioquímica IB3603
IB2105 Microbiología Aplicada; IB 3204 Ingeniería
El curso es requisito de:
Bioquímica
Asistencia: Libre

Suficiencia: SI
Posibilidad de
SI
reconocimiento:
II Semestre 2022
Vigencia del programa:

2 Descripción El presente curso permite al estudiante conocer los fundamentos de la bioquímica

general como ciencia, identificando los aportes esenciales de esta materia al desarrollo
científico y tecnológico. Gran parte de la Biotecnología está estrechamente ligada con
técnicas y conceptos bioquímicos, por lo que el presente curso aporta una base

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 sustancial para cursos obligatorios y electivos como los de Microbiología Aplicada,
Microbiología Industrial, Cultivo de Tejidos I y II, Biología Molecular, Tratamiento
Biotecnológico de Aguas Residuales, Biotecnología de los Microorganismos, Fisiología
(vegetal y humana), Sistemas biotecnológicos de Producción, Fundamentos del
Cultivo de Células Animales, y otros.
Se espera que el estudiante tenga un papel protagónico y activo en su proceso de
aprendizaje, participando de las sesiones tanto presenciales como virtuales, así como
preparándose para cada sesión sincrónica revisando el material asignado y
participando de las actividades asincrónicas. Se promoverá la ejecución de prácticas,
investigaciones, revisiones bibliográficas, análisis de casos, y otras estrategias que
promuevan el aprendizaje auténtico, incluyendo el desarrollo de investigaciones
bibliográficas puntuales que ayuden al estudiante a formarse un concepto integral de
los temas revisados, así como familiarizarse con el proceso de preparación y
sometimiento de artículos científicos.
A lo largo del curso se dará especial importancia al desarrollo de actitudes y valores
como la responsabilidad, la disciplina, la ética, la tolerancia y el respeto por las ideas
de los demás. Se promoverá el desarrollo de atributos como el análisis de problemas;
investigación, diseño, uso de herramientas de ingeniería; trabajo individual y en
equipo; habilidades de comunicación, profesionalismo, impacto de la ingeniería en
la sociedad y el medio ambiente, ética y equidad; y aprendizaje continuo.
Además, se considerarán ejes transversales de la carrera como la creatividad e
innovación, la investigación y el emprendimiento, la bioética, y la protección
ambiental.

3 Objetivos
Nivel de desarrollo de
cada atributo que se
Atributo(s)
Objetivo(s) del curso planea alcanzar:
correspondiente(s)
Inicial - I, intermedio -
M o avanzado - A
1. Describir la estructura y función Conocimiento base de Intermedio (M)
de las moléculas biológicas y ingeniería
catalíticas para relacionar su rol en
los seres vivos.
2. Reconocer procesos metabólicos Conocimiento base de Intermedio (M)
para comprender y analizar ingeniería
procesos vitales de los organismos,
así como su regulación, integración
y sus variaciones (patológicas o
productivas).

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 3. Conocer los conceptos básicos de Aprendizaje continuo Intermedio (M)
la bioquímica aplicados a procesos
biotecnológicos.
4. Producir elementos investigativos Conocimiento base de Intermedio (M)
para familiarizarse con su proceso ingeniería
de divulgación de manera oral y
escrita.
5. Analizar, integrar y sintetizar de Aprendizaje continuo Intermedio (M)
forma crítica el conocimiento y
atributos adquiridos a lo largo del
curso.
6. Reconocer y analizar información Aprendizaje continuo Intermedio (M)
especializada de diferentes fuentes
que permita la actualización
permanente en campos
relacionados a las ciencias
biomédicas y de la vida.

4 Contenidos

Tiempo
Objetivo específico Temas y Subtemas
estimado
3 horas 1. Analizar y discutir el programa del 1- Introducción del programa del curso.
presenciales, curso. a) Definición de Bioquímica y los campos de acción
6 horas 2. Distinguir los principales grupos de esta ciencia.
extra clase funcionales de importancia en b) Relación Bioquímica y Biotecnología
reacciones bioquímicas.
2- Introducción al estudio de las biomoléculas:
Carbohidratos, lípidos, aminoácidos (y agua)
a) Composición química de las biomoléculas.
b) Grupos funcionales importantes y estructura
tridimensional.
c) Ionización del agua, ácidos y bases débiles
d) Conceptos de pH y amortiguadores.
3 horas 1.Analizar la estructura química y 2- Estudio de las biomoléculas (continuación)
presenciales, propiedades químicas de los Carbohidratos, lípidos, aminoácidos (y agua)
6 horas principales grupos de biomoléculas e) Clasificaciones posibles de cada grupo de
extra clase 2.Reconocer los diferentes tipos de biomoléculas
conformación proteica y los métodos f) Principales funciones de cada grupo de
de desnaturalización proteica. biomoléculas
g) Polimerización de cada grupo de biomoléculas

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 3 horas 3- Proteínas: Estructura y función
presenciales, a) Aminoácidos: estructura y propiedades.
6 horas b) El enlace peptídico y formación de cadenas
extra clase polipeptídicas.
c) Los cuatro niveles básicos de estructuración.
d) Configuración y conformación de las proteínas
e) Desnaturalización de las proteínas.
f) Proteína alostéricas y su activación.
g) Diferentes funciones proteicas
h) La vía de la ubiquitina proteosoma

3 horas 1. Discriminar la actividad enzimática, 4- Enzimas: conceptos básicos, cinética y regulación

presenciales, sus diferentes componentes y el a) a) Actividad y especificidad enzimática.
6 horas concepto de catalizador biológico. b) b) El concepto de energía libre y su relación con la
extra clase 2. Interpretar el modelo de Michaelis- constante de equilibrio.
Menten para visualizar las reaccionesc) c) Aceleración de reacciones y estado de transición.
enzimáticas, los principales d) d) El modelo de Michaelis-Menten y Lineweaber-
parámetros de las reacciones Burk
enzimáticas y los mecanismos de e) e) Valores de KM y Vmáx: su determinación,
regulación enzimática. interpretación y relevancia.
3. Explicar qué son las coenzimas y las
f) f) Inhibición enzimática.
reacciones en las cuales participan. g) g) Cofactores y coenzimas.
h) h) Regulación enzimática
1. 3 horas 1. Conocer los principales procesos 5- Introducción al metabolismo
presenciales, involucrados en la energética de la a) Consideraciones bioenergéticas
6 horas vida b) Principales rutas del metabolismo energético
extra clase 2. Identificar los principales c) Principales mecanismos de control metabólico
mecanismos de control metabólico
3. Comprender los procesos 6- Metabolismo de carbohidratos (Catabolismo)
catabólicos de polisacáridos de a) Glicólisis aerobia y anaerobia
reserva, y diferenciarlos de b) Regulación de la glicólisis
carbohidratos estructurales y c) Destinos metabólicos del piruvato
glucoproteínas d) Entrada de diversos azúcares en la ruta glicolítica
e) Glucogenólisis, degradación de almidón y su
regulación
2. 3 horas 3. 1-Comprender la oxidación como 7- Principios de bioenergética
presenciales, fuente de energía metabólica a) Oxidación como fuente de energía metabólica
6 horas 4. 2-Identificar el ciclo de Krebs como b) ATP como moneda de energía libre
extra clase proceso anfibólico, su importancia y
regulación 8- Ciclo del ácido cítrico
5. 3-Identificar pasos clave del transporte a) Oxidación del piruvato
electrónico y la fosforilación oxidativa b) Acción y regulación del complejo piruvato
deshidrogenasa

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 6. 4-Conocer las implicaciones del c) Reacciones del ciclo del ácido cítrico
metabolismo del oxígeno d) Regeneración del oxalacetato y reacciones
anapleróticas
e) Estequiometría y energética del ciclo del ácido
cítrico
f) Carácter anfibólico del ciclo

9- Fosforilación oxidativa
a) Estructura y función mitocondrial
b) Transporte electrónico
c) Complejos enzimáticos de la cadena respiratoria
d) Fosforilación oxidativa y su regulación
e) Rendimiento energético
f) El oxígeno como sustrato para otras reacciones
metabólicas
g) Especies reactivas de oxígeno (aportes y perjuicios)
3 horas1. 1- Comprender la relevancia 10- Metabolismo de hidratos de carbono
presenciales, fisiológica de la síntesis de glucosa en (Anabolismo)
6 horas los animales a) Gluconeogénesis
extra clase
2. 2-Estudiar el papel metabólico de b) Regulación y movilización del glucógeno
carbohidratos “no energéticos” c) Glucogenesis
d) Biosíntesis de aminoazúcares y glucoconjugados
e) Ruta de las pentosas fosfato
3 horas 1- Conocer los principales procesos 11- Metabolismo de compuestos nitrogenados
presenciales, involucrados en el catabolismo de (Catabolismo)
6 horas compuestos nitrogenados, su a) Nitrógeno inorgánico y amoniaco
extra clase utilización y recambio b) Balance del nitrógeno
2- Identificar moléculas nitrogenadas c) Degradación de aminoácidos y recambio proteico
diferentes a los aminoácidos y d) Degradación de bases nitrogenadas
proteínas e) Neurotransmisores y reguladores biológicos
3- Conocer los principios de la
biosíntesis de compuestos 12- Metabolismo de compuestos nitrogenados
nitrogenados (Anabolismo)
a) Síntesis de aminoácidos
b) Síntesis de bases nitrogenadas

3 horas 1- Comprender la relevancia del tejido 13- Metabolismo de compuestos lipídicos

presenciales, graso en el metabolismo (Catabolismo)
6 horas 2- Identificar las principales reacciones a) Utilización y transporte de grasas y colesterol
extra clase implicadas en la síntesis de grasas y b) Activación de los ácidos grasos
colesterol c) Oxidación de ácidos grasos saturados e insaturados
3- Relacionar el metabolismo de grasas d) Oxidación de ácidos grasos de cadena par e impar
con la salud humana e) Cetogénesis

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 f) Ácidos grasos esenciales y su relación con procesos
biológicos como la inflamación
g) Otras implicaciones del tejido graso

14- Metabolismo de compuestos lipídicos

(Anabolismo)
a) Relación con el metabolismo de carbohidratos
b) Biosíntesis de ácidos grasos
c) Biosíntesis de triglicéridos
d) Biosíntesis de colesterol
e) Eicosanoides: Tromboxanos, Leucotrienos y
Prostaglandinas
f) Obesidad y sus implicaciones
3 horas 1- Conocer los principales lípidos de 15- Transporte a través de membranas
presenciales, membrana y su importancia a) Estructura y propiedades de las membranas
6 horas metabólica biológicas
extra clase 2- Identificar mecanismos de b) Organización de las membranas y principales
transporte a través de membrana lípidos que las componen
3- Conocer los principales mecanismos c) Principales mecanismos de transporte a través de
de comunicación celular y sus membrana: Transporte pasivo (difusión), Transporte
características facilitado y Transporte activo

16- Transducción de señal

a) Tipos de receptores
b) Principales procesos de transducción de señal
c) Proteínas G y segundos mensajeros
d) Implicación de los lípidos en procesos de
inflamación
3 horas 1- Distinguir las principales diferencias 17- Vitaminas
presenciales, de la digestión y absorción entre las a) Vitaminas hidrosolubles
6 horas distintas biomoléculas y b) Vitaminas liposolubles
extra clase micronutrientes c) Función, fuentes, dosis de las vitaminas y
problemas asociados a su deficiencia

18- Digestión y absorción

a) Digestión y absorción de carbohidratos
b) Digestión y absorción de proteínas y aminoácidos
c) Digestión y absorción de compuestos lipídicos
d) Digestión y absorción de vitaminas y
micronutrientes

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6 horas 1- Comprender la interacción que 19- Integración del metabolismo
presenciales, ocurre entre vías metabólicas y cómo a) Retroalimentación y regulación de las vías
12 horas se ven afectadas por algunos factores metabólicas
extra clase fisiológicos b) Integración hormonal
c) Ayuno e Índice glicémico
d) Efecto del ejercicio y principales biohacks en el
metabolismo
e) Ejemplos de trastornos congénitos del
metabolismo humano

3 horas 1- Conocer la relevancia de los análisis 20- Uso de análisis bioquímicos en aplicaciones
presenciales, bioquímicos a la salud humana agronómicas, industriales y biomédicas
6 horas 2- Reconocer a la bioquímica como a) Aportes de la bioquímica al tamizaje, pronóstico,
extra clase disciplina y ciencia interdisciplinar diagnóstico, tratamiento y seguimiento de
3- Identificar las principales técnicas condiciones humanas y animales
bioquímicas utilizadas en el trabajo b) Aportes de la bioquímica al control de plagas,
agronómico optimización de procesos y otros
4- Comprender la relevancia de las c) Aportes de la bioquímica al control de calidad en
enzimas en procesos industriales procesos industriales
5- Conocer la aplicabilidad de técnicas d) Uso de enzimas en procesos diversos
bioquímicas en procesos industriales
18 horas 1. Fomentar la investigación y 21- Investigación bibliográfica
extra clase presentación de temas específicos y a) Paralelo al desarrollo del curso los estudiantes
actuales de relevancia en el campo deberán desarrollar un trabajo de investigación sobre
bioquímico. algún tema biotecnológico relevante, empleando los
2- Conocer el proceso de conocimientos y herramientas adquiridas durante el
sometimiento de artículos científicos curso.
para su publicación

II parte: Aspectos operativos

5 Metodología El curso comprende varias metodologías como, por ejemplo, técnicas expositivas,
de enseñanza interrogativas, mini-debates, demostrativas, análisis de casos, revisiones
y aprendizaje bibliográficas, y otras estrategias que promuevan el aprendizaje auténtico y
pretende que el estudiante desarrolle investigaciones bibliográficas puntuales que
le ayuden a formar un concepto integral de los temas revisados, identificar fuentes
confiables y robustas, así como familiarizarse con el proceso de preparación y
sometimiento de artículos científicos.

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 Al ser semipresencial, las clases a distancia se impartirán mediante herramientas
virtuales (Zoom), serán grabadas y puestas a disposición de los estudiantes para su
posterior consulta. Para esto, es requisito que el estudiante cuente con acceso a un
dispositivo electrónico con pantalla, bocinas y micrófono, de forma que pueda
seguir y participar activamente de las sesiones sincrónicas, y hacer
aprovechamiento de las asincrónicas. El curso contará con un espacio en la
plataforma del Tec-Digital desde donde se compartirá el material, las grabaciones
de las clases, se aplicará evaluaciones formativas y sumativas, y donde se
registrarán las calificaciones obtenidas para cada una de ellas. Es responsabilidad
de cada estudiante consultar con frecuencia esta plataforma y lo que en ella se
publique.
Al finalizar el curso el estudiante será capaz de:
• Describir la estructura y función de las macromoléculas y micronutrientes
como por ejemplo proteínas, lípidos, los ácidos nucleicos y vitaminas para
relacionar su importancia e interacción en los organismos vivos.
• Analizar distintas biomoléculas, sus propiedades fisicoquímicas y procesos
relacionados a su metabolismo.
• Reconocer conceptos centrales bioquímicos para comprender y analizar
procesos vitales de los organismos vivos, su metabolismo y procesos
patológicos.
• Razonar en forma creativa y crítica al enfrentarse a problemas productivos,
casos clínicos u otros, para darles solución o comprensión, identificando y
jerarquizando en forma adecuada los principales datos del caso, evidencia y
herramientas disponibles.
• Debatir respetando las opiniones ajenas y buscando el consenso mediante
argumentación basada en evidencia y conocimientos científicos.
• Producir elementos investigativos de forma apropiada para su divulgación
oral o escrita.
• Reconocer la importancia y aplicaciones de la bioquímica para el ejercicio
profesional de la Ingeniería en Biotecnología

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6 Evaluación Evaluación sumativa
Item Valor %
Tres exámenes parciales 60
Evaluaciones cortas 20
Trabajo de investigación 15
Análisis de casos 5
TOTAL 100%

Sobre la presentación del trabajo de investigación:

• Consiste en la preparación de un artículo científico de revisión bibliográfica.
Como tal, implica cierto nivel de profundidad en los conceptos revisados y su
análisis, así como la utilización de referencias robustas, confiables y
destacadas.
• Se deberá presentar en grupos de 5 estudiantes. Los integrantes y temas se
deberán definir en las dos primeras semanas del curso.
• La calificación incluirá el trabajo escrito, así como la aplicación a una revista
científica.
• La calificación del trabajo escrito comprenderá la presentación de avances e
implementación de correcciones. El formato dependerá de la revista
científica a la que se decida someter la revisión. Idealmente se presentará un
trabajo de 3000 palabras (5 a 6 páginas).

Sobre las evaluaciones y aprobación del curso:

• Todas las evaluaciones que se realicen fuera del horario del curso deben
presentarse cargándolas dentro del horario establecido en el Tec-Digital.
Toda evaluación entregada por otro medio o fuera del tiempo establecido
será considerada como NO entregada y NO se calificará.
• A pesar de que el curso es de asistencia libre, se realizarán evaluaciones
cortas participativas, para las cuales aplican los términos y condiciones
definidas en el reglamento de evaluación.
• El estudiante aprobará el curso si obtiene al final del semestre un 70% o más
del total de la evaluación. Si el estudiante obtiene en su nota final de un 60
a un 69.51, tendrá derecho a un examen de ampliación.
• Los procesos de revisión, entrega y reclamos de evaluaciones y trabajos se
regirán según lo establecido en el reglamento de Enseñanza-Aprendizaje del
ITCR.

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7 Bibliografía Bibliografía recomendada:
Mathews, C.K. y Van Holde, K.E, Appling, D.R. & Anthony-Cahill, S.P K.G. 2013.
Bioquímica. 4 ed. Pearson Educación S.A. Madrid, España. 1376 pp.
Lehninger, A., Nelson, D. y Cox, M. 1993. Principles of Biochemistry. 2 ed. Worth
Publishers, Inc. New York. 1013 pp.
Bruce, A. et al. Molecular Biology of the Cell. 7th Edition. IBSN: 978-0-393-88484-5 (E-
book) 978-0-393-88482-1 (Hardcover). 1552 pp.
Stryer, L. 1995. Bioquímica. 4 ed. Editorial Reverté, S.A. España. 1010 pp.
Devlin, T. M. 2010. Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations. 7th Edition.

Adicionalmente se contará con bibliografía obligatoria para cada tema, que se hará
disponible por medio de la plataforma del Tec-Digital. Es responsabilidad de cada
estudiante consultar con frecuencia esta plataforma y lo que en ella se publique.

8 Profesora Carolina Centeno Cerdas. Ingeniera en Biotecnología del Instituto Tecnológico de Costa
Rica. Máster en Ciencias Biomédicas con énfasis en Fisiología Celular de la Universidad
de Costa Rica. Doctora en medicina experimental con énfasis en medicina regenerativa
e ingeniería de tejidos de la Universidad Técnica de Múnich, Alemania. Profesora e
investigadora con 20 años de experiencia en estudios clínicos y pre-clínicos en áreas de
diagnóstico molecular, ingeniería de tejidos y medicina regenerativa.

Email: [email protected]. Tel. Oficina: 2550-4594

Oficina frente a la entrada principal de la escuela de biología, en el primer piso del
edificio F1, diagonal a la secretaría de la escuela.
Horario de consulta: a definir con la profesora.

La modalidad (presencial o mediante tecnologías de información) se puede convenir

entre profesora y estudiantes mediante cita previa, el horario también es flexible de
ser requerido.

Anexo:

9 Cronograma

Semana Fecha Actividad

Introducción al curso
1 25 - 29 Jul
Estudio de las biomoléculas (carbohidratos, agua)

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 Estudio de las biomoléculas (lípidos y aminoácidos)
2 01 - 05 Ago *Fecha límite para la definición de temas y grupos de trabajo (no requiere
entrega, sino coordinación)
3 8 -12 Ago Proteínas: Estructura y función
Enzimas: conceptos básicos, cinética y regulación
4 15 - 19 Ago *Entrega de “outlines” y revista seleccionada para someter el artículo de
revisión (2%)
Introducción al metabolismo
5 22 - 26 Ago
Metabolismo de carbohidratos (Catabolismo)
6 29 Ago - 02 Set I Examen Parcial
Principios de bioenergética
7 05 - 09 Set Ciclo del ácido cítrico
Fosforilación oxidativa

8 12 - 16 Set Metabolismo de hidratos de carbono (Anabolismo)

9 19 -23 Set Actividades formativas / Semana de Biotecnología

Metabolismo de compuestos nitrogenados (Catabolismo)
10 26 - 30 Set
Metabolismo de compuestos nitrogenados (Anabolismo)
Metabolismo de compuestos lipídicos (Catabolismo)
11 03 - 07 Oct Metabolismo de compuestos lipídicos (Anabolismo)
*Entrega del artículo de revisión (7%)
12 10 - 14 Oct II Examen Parcial
Transporte a través de membranas y transducción de señal
13 17 - 21 Oct
*Análisis de caso (clínico)

Digestión y absorción
14 24 - 28 Oct
Vitaminas

Integración del metabolismo

15 31 Oct - 04 Nov *Entrega del artículo de revisión en versión final para sometimiento a la
revista científica (4%)

Integración del metabolismo

16 07 - 11 Nov
*Entrega de la prueba de sometimiento a la revista científica (2%)

17 14 -18 Nov III Examen Parcial Comprensivo

18 21 - 25 Nov Examen de Ampliación
19 28 - 30 Nov Entrega de actas

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