ORF6

ORF6
베타코로나바이러스NS6단백질
식별자
기호.bCoV_NS6
팜PF12133
인터프로IPR022736

ORF6는 사스-CoV와 사스-CoV-2를 포함한 사르베코바이러스 아속 코로나바이러스의 바이러스 보조 단백질을 코드하는 유전자다.메르스-CoV에는 존재하지 않는다.그것은 인터페론 [1][2][3]길항작용을 통해 바이러스 감염에 대한 면역체계 반응을 감소시키는 것으로 생각된다.

구조.

ORF6 단백질은 SARS-CoV에서[2] 63개의 아미노산 잔류물과 SARS-CoV-2에서 [3]61개의 아미노산 잔류물로 상당히 적다.ORF6 시퀀스는 잘 보존되지 않고 두 바이러스 사이의 시퀀스 식별성이 약 66%[4]로 비교적 낮습니다.그것은 막과 결합하는 양친매성 N 말단 알파 나선을 가지지만, 막 통과 단백질은 아니다.약 20개의 잔류 C 말단 꼬리는 극성이며 세포 내로 확장되며 단백질 전달을 [1][2]위한 신호 시퀀스를 포함합니다.

표현과 현지화

다른 보조 단백질의 유전자와 마찬가지로, ORF6 유전자는 코로나 바이러스 RNA 게놈의 5' 말단에 구조 단백질을 코드하는 유전자 근처에 있습니다.ORF6은 ORF7a, ORF7b, ORF8과 함께 막(M)과 뉴클레오캡시드([1][2][3]N) 유전자 사이에 위치한다.또한 SARS-CoV-2에 대한 연구는 오토파고솜과 [3]리소좀과 같은 소포와의 연관성을 나타내며, 소포체 및 골지 [1][2][3]기구에 국소화된다.

기능.

ORF6 단백질의 주요 기능은 면역조절과 인터페론 길항작용으로 생각됩니다.바이러스 복제에 필수적인 것은 아니지만, 없는 경우 복제 [1][2]효율성이 저하되는 것으로 보입니다.

바이러스 단백질 상호작용

SARS-CoV에 대한 연구는 ORF6 단백질이 다른 바이러스 보조 단백질인 ORF9b [1][5]단백질과 단백질-단백질 상호작용을 보인다는 것을 시사한다.사스-CoV에서는 재조합 쥐형 간염 바이러스에서는 ORF6 단백질이 바이러스 유사 입자와 성숙한 비리온에서 검출되어 작은 바이러스 구조 [1][2]단백질일 수 있음을 시사한다.

면역 효과

SARS-CoV와 SARS-CoV-2의 ORF6 단백질은 간섭제이며 면역 회피에 관여하는 것으로 생각된다.이 효과를 중재하기 위해 숙주 세포 단백질과 여러 단백질-단백질 상호작용이 설명되었다.STAT 전사 인자의 핵 수입을 억제하여 간섭체 [1][3]활성화를 저해하는 것으로 보고되었다.SARS-CoV에 대한 연구는 이것이 ORF6 단백질이 카리오페린에 [1][4]결합함으로써 매개될 수 있다고 보고한다.SARS-CoV-2에서는 ORF6 단백질이 RAE1, NUP98과 상호작용해 카리오페린 상호작용을 [3][6]차단하는 것으로 알려졌다.

레퍼런스

  1. ^ a b c d e f g h i Liu, Ding Xiang; Fung, To Sing; Chong, Kelvin Kian-Long; Shukla, Aditi; Hilgenfeld, Rolf (September 2014). "Accessory proteins of SARS-CoV and other coronaviruses". Antiviral Research. 109: 97–109. doi:10.1016/j.antiviral.2014.06.013. PMC 7113789. PMID 24995382.
  2. ^ a b c d e f g McBride, Ruth; Fielding, Burtram (7 November 2012). "The Role of Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS)-Coronavirus Accessory Proteins in Virus Pathogenesis". Viruses. 4 (11): 2902–2923. doi:10.3390/v4112902. PMC 3509677. PMID 23202509.
  3. ^ a b c d e f g Redondo, Natalia; Zaldívar-López, Sara; Garrido, Juan J.; Montoya, Maria (7 July 2021). "SARS-CoV-2 Accessory Proteins in Viral Pathogenesis: Knowns and Unknowns". Frontiers in Immunology. 12: 708264. doi:10.3389/fimmu.2021.708264. PMC 8293742. PMID 34305949.
  4. ^ a b Suryawanshi, Rahul K.; Koganti, Raghuram; Agelidis, Alex; Patil, Chandrashekhar D.; Shukla, Deepak (March 2021). "Dysregulation of Cell Signaling by SARS-CoV-2". Trends in Microbiology. 29 (3): 224–237. doi:10.1016/j.tim.2020.12.007. PMC 7836829. PMID 33451855.
  5. ^ Calvo, Enrique; DeDiego, Marta L.; García, Pilar; López, Juan A.; Pérez-Breña, Pilar; Falcón, Ana (October 2012). "Severe acute respiratory syndrome coronavirus accessory proteins 6 and 9b interact in vivo". Virus Research. 169 (1): 282–288. doi:10.1016/j.virusres.2012.07.012. PMC 7114373. PMID 22820404.
  6. ^ Miorin, Lisa; Kehrer, Thomas; Sanchez-Aparicio, Maria Teresa; Zhang, Ke; Cohen, Phillip; Patel, Roosheel S.; Cupic, Anastasija; Makio, Tadashi; Mei, Menghan; Moreno, Elena; Danziger, Oded; White, Kris M.; Rathnasinghe, Raveen; Uccellini, Melissa; Gao, Shengyan; Aydillo, Teresa; Mena, Ignacio; Yin, Xin; Martin-Sancho, Laura; Krogan, Nevan J.; Chanda, Sumit K.; Schotsaert, Michael; Wozniak, Richard W.; Ren, Yi; Rosenberg, Brad R.; Fontoura, Beatriz M. A.; García-Sastre, Adolfo (10 November 2020). "SARS-CoV-2 Orf6 hijacks Nup98 to block STAT nuclear import and antagonize interferon signaling". Proceedings of the National Academy of Sciences. 117 (45): 28344–28354. doi:10.1073/pnas.2016650117. PMC 7668094. PMID 33097660.