Nomenclatura Estereoquímica

Sistema de Nomenclatura R / S

El sistema de nomenclatura R/S fue propuesto por Cahn, Ingold y Prelog, y aceptado en 1956 por la
comunidad científica. En este método se da a cada sustituyente sobre un átomo estereogénico una
prioridad. Hecho esto, se observa la molécula del lado contrario al sustituyente de menor prioridad y se
establece la dirección del sustituyente de mayor prioridad al segundo, y de éste al tercero. Si esta dirección
sigue el sentido de las agujas del reloj, decimos que la configuración es R (latín rectus = derecho), y si
esta dirección es en sentido contrario, la configuración será S (latín sinister = izquierdo).

1 1

S
3
4
=
2 3 2

1 1
R
S

2
4
=
3 2 3

Las reglas de prioridad se pueden condensar en las siguientes cuatro:

Regla 1.- Se ordenan los sustituyentes en base al número atómico creciente, por ejemplo:

I > Br > Cl > S > P > Si > F > O > N > C > H

2 1 Br
Cl
4 4
H H

Br COOH Cl COOH
1 R 3 2 S 3

Regla 2.- Si existe más de un sustituyente con el mismo número atómico enlazado al átomo
estereogénico, tenemos que considerar su sustitución aplicando las prioridades indicadas en la regla
número 1. Por ejemplo: −CH2Br > −CH2Cl > −CH2OH > −CH2CH3 > −CH3

1 1 CH CH OH
CH2Cl 2 2
H4 H4

H3 C CH2 OH H3 C CH2 CH3

R R
3 2 3 2
Subregla: Grupos alquílicos terciarios son prioritarios frente a grupos secundarios y éstos frente a
grupos alquílicos primarios.

H 4
CH(CH 3)2 > CH2CH2CH3 > CH3 > H

3 R 2 1 2 3 4

Subregla: En un punto ramificado se procede a estudiar la rama prioritaria. Ejemplos:

Cadenas preferentes 1
OH
OH H 4
HO
OCH 3 HO OCH 3
CH C CH
3 R 2

CH 3 3
CH3
HO
H 4
CH C CH
HO

H
2 R 1
CH2 OH

CH 2OH

Cadenas preferentes

Cadenas preferentes

CH3 3
CH 3
HO
H4
CH C CH
HO

H 1 S 2

HOH 2C CH2OH

HOH 2C CH2OH

Nota: en este último ejemplo, las ramas inferiores en principio preferentes son iguales, por lo que no
se pueden elegir. Las superiores pasan a ser preferentes.
 Regla 3.- Los dobles y triples enlaces adquieren dos o tres sustituciones formales, dependiendo del
caso.

C C C C C O C O

C C O C

C C N C

C C C C C N C O

C C N C

Esto conlleva a que: −COOH > −CO-CH3 > −CHO > −CH2OH

De igual manera: −C≡N > −CH=NH > −CH≡CH > −CH=CH2 > −CH2-CH3

En aromáticos tendríamos:
C

C C

R CH3 R CH 3
C C
C
Ejemplos:
2
CHO CHO
H 4
H OH
HO CH2OH
1 R
CH2OH 3

D-(+)-gliceraldehido R-(+)-gliceraldehido

2
COOH COOH
H 4
H2N H 3
HOH2 C NH 2
S
CH2OH 1

L-serina S-serina
Nota importante: Sin variar la configuración real del átomo estereogénico, puede cambiar el descriptor R ó
S al variar átomos a dos o tres átomos de distancia. Ejemplo:

2 3 2
CH2OH CH2OAc CH2OH CH2OAc

HO CH2 OH AcO CH2OCH3 HO CH2OCH3 AcO R CH2OH

1
R 3 1 S 2 1 3
aquiral

Regla 4.- En presencia de isótopos, la prioridad la tiene aquel de mayor masa atómica.

Por ejemplo: 3H (tritio) > 2H (deuterio) > 1H (hidrógeno) o 13C > 12C.

1
Cl

D COOH
3
R 2

Formas meso y átomos pseudoasimétricos

Definición de meso: Es el descriptor empleado para un miembro aquiral de un grupo de estereoisómeros

que incluye al menos un miembro quiral.
El ácido tartárico en vez de tener cuatro estereoisómeros posee sólo tres, una pareja de enantiómeros y un
estereoisómero aquiral. Este último recibe el nombre de forma meso.

H COOH HO COOH
S S H R R OH
HO H
HOOC OH HOOC H
ácido (−)-tartárico ácido (+)-tartárico

σ
H COOH HO COOH HOOC COOH
S R OH R S H H R S H
HO i H i
HOOC H HOOC OH HO OH

= centro de inversión ácido meso tartárico

σ = plano de simetría
Puede parecer que el ácido meso tartárico tiene un plano de simetría (figura superior derecha). Sin
embargo, las proyecciones de Fisher no representan normalmente la configuración más estable. La
configuración más estable es la que se muestra a la izquierda, y podemos observar que posee un centro de
simetría o inversión. Como es de esperar los propiedades físicas de los formas meso son diferentes a la de
sus diasterómeros quirales. Así:
- Punto fusión del ácido meso tartárico = 140 °C
- Punto fusión del ácido (+)-tartárico = 170 °C
- Punto fusión del ácido (−)-tartárico = 170 °C
Un caso algo más complejo es el del ácido trihidroxiglutárico, que existe como una pareja de enantiómeros y
dos formas meso.
HO H HO H

HOOC S S COOH HOOC R R COOH

3
H OH
H OH OH HO H H

quiral quiral

HO H H OH

HOOC R S COOH HOOC R S COOH

s r
H H
HO H OH HO H OH

aquiral (meso) aquiral (meso)

R>S
C3 centro seudoasimétrico

El C3 no es estereogénico en los estereoisómeros quirales y si lo es en los estereoisómeros meso. Por

tanto el C3 es un centro de estereoisomerismo (pasa de una forma meso a la otra) que recibe el nombre de
centro “seudoasimétrico”. Al no ser un centro quiral el uso del término seudoquiral no es correcto. Mislow y
Siegel sugieren definirlo como centro estereogénico no quiróptico.

Nomenclatura: Al ser estos átomos (C3) aquirotópicos, no es correcto denominarlos centros quirales y
asignarles un descriptor R ó S. La notación para estos casos es usar una r ó s minúscula para distinguirlos
de los centros quirales. En la ordenación de los ligandos se sigue la regla R es preferente a S.

Definiciones de Configuración Absoluta y Relativa

Definición de configuración absoluta: Es la disposición espacial de los átomos en una molécula quiral
que la distingue de su imagen especular, y de su descriptor estereoquímico.

Definición de configuración relativa: Es la configuración de cualquier elemento estereogénico con

respecto a la de cualquier otro elemento estereogénico en la misma molécula.
Las proyecciones de “cuña ordenante” y la zig-zag son muy útiles para mostrar las conformaciones y
configuraciones de compuestos conteniendo dos o más centros estereogénicos. Veamos la glucosa:

1 CHO

2 R
H OH HO HO OH OH
H H
3 S
HO H HOH2C HOH 2C 5
R R S R S
R CHO R R
4 R 5 3 3 CHO
H OH 1 1
H OH HO H OH OH
5 R
H OH
cuña ondeante zig-zag
6 CH 2OH

proyección de Fisher
D-(+)-glucosa

Las formulas de Newman y los caballetes se emplean para moléculas que no contengan más de dos
centros estereogénicos. Las formulas zig- zag y las cuñas ordenantes tienen la ventaja de mostrar a la
molécula en la conformación alternada. La formula zig-zag, aunque más simple, sólo puede ser usada para
centros estereogénicos que posean un átomo de hidrógeno, dado que éste átomo se asume y no se dibuja.

La anotación de compuestos con dos centros estereogénicos debe en principio ser simple: a cada centro se
le da su descripción R/S junto con su número posicional.

Así, la D-(+)-glucosa es (2R, 3S, 4R, 5R)-2,3,4,5,6–pentahidroxihexanal

Este sistema funciona bien para compuestos no racémicos y que conozcamos sus configuraciones
absolutas en cada centro estereogénico. Pero si se trata de racematos, o si sólo conocemos la
configuración relativa, el sistema requiere modificarse.
Para los racematos, los símbolos RS ó SR se usan para los centros estereogénicos. El centro
estereogénico de menor numeración actúa de referencia y será siempre RS, nunca SR.

Así para la glucosa en forma racémica abierta tendríamos:

(2RS, 3SR, 4RS, 5RS)-2,3,4,5,6-pentahidroxihexanal.

no se puede poner (2SR,3RS, 4SR, 5SR)- 2,3,4,5,6-pentahidroxihexanal.

El Chemical Abstracts (CA) emplea otro sistema: el centro estereogénico de menor numeración se le asigna
el descriptor R*, y la configuración de los otros centros se anotan como R* ó S*.

Así, para la glucosa racémica sería: 2R*, 3S*, 4R*,5R*.

El Sistema Beilstein usa el prefijo rel (relativo) para el mismo ejemplo: rel-(2R, 3S, 4R, 5R)
Existen más reglas para definir la quiralidad de las moléculas, pero las veremos según vayamos estudiando
los correspondientes compuestos a lo largo del curso o en cursos más avanzados (compuestos con ejes y
planos de quiralidad, helicidad, etc.).

Sistema de Nomenclatura Z/E para Alquenos

Descriptores usados para especificar la configuración de dobles enlaces (cis / trans) y Z/E:

Los descriptores cis y trans se usan como prefijo de los nombres de compuestos conteniendo un doble
enlace estereogénico. Indica que los dos ligando de referencia están bien en el mismo lado (cis) o de lados
opuestos (trans) al plano de referencia. El plano de referencia es el que conecta los dos átomos que forman
el doble enlace, y es perpendicular al plano en el que residen los ligandos. Es usual que los sustituyentes o
ligandos de referencia sean idénticos como los átomos de hidrógeno de los siguientes compuestos.

H H H COOH

Br Cl H 3C H

cis-1-bromo-2-cloroetileno ácido trans-2-butenoico

Los descriptores E y Z especifican la configuración de un doble de una manera más general que los
términos cis y trans. De hecho, esta terminología hace uso de las reglas de Cahn, Ingold y Prelog para
seleccionar los ligandos de preferencia en cada extremo del doble enlace. Cuando los ligando de mayor
prioridad están orientados hacia lados opuestos del plano de referencia, se emplea el descriptor E. En caso
contrario el símbolo que se utiliza es la Z.

E (del alemán entgegen: opuesto).

Z (del alemán zusammen: juntos).

H3C H H 3C H H3C CH 3

Br CH 2Br H CH3 H H
Z E Z
trans cis

Generalmente E es igual que trans y Z equivalente a cis, pero no siempre, por ejemplo:
 H 3C COOH

H CH 3
Z
trans
Este compuesto sería según la nomenclatura antigua trans, que equivaldría a E, pero es realmente Z.

Otros ejemplos:

Cl CN Cl Cl H3CH2C H

H Cl H CN H Br
E Z E

C
C
C
C

H C

C
H CH 2CH3 C
E
H C CH2CH 3
H
E

Cl

CH3

H E
Z

H H
4
H
Z 2
H3C
E COOH
H
1

ácido (2E, 4Z)-2,4-hexadienoico

 Descriptores de Configuración Relativa

Aunque las anotaciones que hemos estudiado son inambiguas, no son inmediatas de obtener. Lo que la
mayoría de los químicos desean es una designación de la configuración “a primera vista” para sistemas con
dos centros estereogénicos.
Esa nomenclatura “a primera vista” está descrita desde hace muchos años y está en los nombres de los
azúcares de cuatro carbonos: la eritrosa y la treosa.

CHO CHO

H OH HO H

H OH H OH

CH2OH CH2OH

D -(−)-eritrosa D-(−)-treosa

Definición: Isómeros con dos ligandos idénticos unidos a cada carbonada situados del mismo lado en la
proyección de Fischer (como en eritrosa ) son llamados eritro, y aquellos con ligandos idénticos en los
lados opuestos (como en treosa.) son llamados treo.

Original Extendida

R R R R

H X H X H X H X

H X X H H Y Y H

R' R' R' R'

eritro treo ¿eritro? ¿ treo?

Ejemplos:

CO2H OH

H CH 3 H CH 3

H 3C H H CH 3

OH Br

ácido treo-3-hidroxi-2-metilbutanoico eritro-3-bromo-2-butanol

En la forma extendida, para dos ligando X e Y distintos, no siempre es fácil determinar si la configuración
relativa es treo ó eritro. Si X e Y, ambos son heteroátomos si se pueden aplicar, pero si uno de ellos es un
alquilo o arilo la determinación se complica.

CH3 OH

H OH H 3C H

H CH3 H CH3

C 2H 5 ¿ eritro o treo ? C 2H 5

La estereoquímica de las reacciones aldólicas se expresa generalmente usando las fórmulas zig-zag de los
productos, y los descriptores sin y anti. Estos descriptores se usan para describir dos sustituyentes (no
hidrógenos) del mismo lado (sin) o de lados opuestos (anti) del plano definido por la cadena.

H3 C O-
H +
R1
R2 base
R2
O

CH 3 CH 3 CH 3 CH3 CH 3 CH3 CH3 CH 3

R2 R2 R2 R2
1 1 1 1
R R R R
+ + +

OH O OH O OH O OH O

2,3-sin 2,3-sin 2,3-anti 2,3-anti

3,4-sin 3,4-anti 3,4-sin 3,4-anti

Símbolos α y β: Los términos α y β se usan principalmente con moléculas tipo esteroides para indicar la
posición de los sustituyentes hacia abajo ó hacia arriba cuando la molécula es vista como se muestra
debajo.

β β
β β β
β
β β
β
α α
β
α
α α
α α β
α α α
α
 17
11
13
1 14

10
H H
5
Colestan-6β-ol
6
H
OH

Cis y trans en compuestos cíclicos: Los descriptores cis y trans delante del nombre de una estructura
cíclica en dos centros estereogénicos indican que los ligandos de referencia están orientados bien del
mismo lado (cis) o de lados opuestos (trans) del plano de referencia, el cual es el plano horizontal que pasa
a través de los centros esterogénicos.

trans-1,2-dimetilciclopentano

OH Cl Cl

Cl Cl

trans-1,4-diclorociclohexano cis-1,4-diclorociclohexano
cis-4-terc-butilciclohexanol