호테아 베르네키

Hortaea werneckii
호테아 베르네키
Hortaea-werneckii-fungus--causes-tinea-nigra.jpg
호테아 베르네키 균의 마이크로그래프
과학적 분류
킹덤:
곰팡이
구분:
아스코미코타
클래스:
도티데오균류
순서:
카프노디알목
패밀리:
테라토스포에리아과
속:
호테아
종:
H. 베르네키
이항식 이름
호테아 베르네키
(호르타) 니심. & 미야지(1984년)

호테아 베르네키(Hortaea wernecii)는 테라토스포세리아과과에 속하는 효모종이다.[1] 그것은 현저한 할로톨러런스로 조사되는 검은 효모다.[2][3] 배지에 소금을 첨가할 필요는 없지만, H. werneci는 포화 NaCl 용액에 가깝게 자랄 수 있다.[4] 이 유별나게 넓은 적응성을 강조하기 위해, 그리고 H. werneci를 최대 염도 한도가 낮은 다른 할로톨러제 균과 구별하기 위해, 일부 저자들은 H. werneci를 "극히 할로톨러제"[4]라고 묘사한다.

H. wernecii의 몇 가지 소금강화 메커니즘이 분자 수준에 대해 연구되었다.[4] 예를 들어, 그것의 주요 호환 용액은 글리세롤, 에리스리톨, 아라비톨, 만니톨이라고 알려져 있다; 세포벽의 멜라닌 축적은 세포 내부에 최소한 글리세롤을 보유하는데 도움을 준다.[3] 고삼투성 글리세롤(HOG) 신호 경로의 여러 구성 요소(삼투성 충격에 대한 반응을 제어하는 것)가 상세하게 연구되었고 일부는 사카로마이오스 세레비시아에 있는 그것들에 비해 기능이 다른 것처럼 보인다.[5][6][7] 고농도의 소금에 대한 적응은 또한 막 지질 구성의 변화를 동반하는데, 주로 인산염 지방산의 불활성화를 증가시킨다.[8][9]

H. wernecii는 희귀한 표면적이고 비침습적인 피부 감염을 일으킨다.[10] 대표적인 증상은 손바닥과 발바닥의 비늘이 없고 매끈하며 갈색 검붉은 통증이 없는 반점이 있다.

액체 매체에서 H. wernecii의 성장은 필라멘트성 성장으로 전환될 수 있지만 효모처럼 되는 경우가 많다. 스위치의 메커니즘은 알려져 있지 않다. 그 세포들은 멜라닌 생성 때문에 갈색으로 보인다.[3]

H. wernecii의[11][12] 전체 게놈 염기서열 분석 결과, 사카로마이오스 세레비시아 계통에서 더 잘 알려진 효모 외에 아스코미테스 효모들 중 유일하게 유전자 전 복제가 보고된 최근의 전체 게놈 복제가 밝혀졌다.[13] 추가 변종의 게놈 염기서열 분석 결과 12개 변종 중 10개 변종은 하플로이드 변종 사이에 여러 번 혼합해 복제된 게놈을 갖고 있어 안정적인 디플로이드가 형성됐다. 이러한 잡종화 사건 외에 성적인 재생산의 흔적은 발견되지 않았다.[14] 그 결과 H. werneci의 게놈은 15974개의 예측 유전자로 비교적 크다(49.9Mb).[12] 할로톨러런스(halotolerance)의 역할을 하는 것으로 생각되는 금속 양이온 트랜스포터를 부호화한 유전자는 진화 과정에서 여러 지점에서 몇 가지 추가적인 유전자 중복을 경험했다.[11]

비록 짝짓기 유전자 중 하나가 일부 변종에서 비활성화된 것일 수 있지만, 모든 염기서열 게놈에서 동음이의 교미 지점이 발견되었다. 그럼에도 불구하고 계통발생학적 분석과 연계불균형 분석은 H. Wernecii가 무성하다는 것을 나타낸다.[14]

참조

  1. ^ "Archived copy". Archived from the original on 2009-08-21. Retrieved 2009-08-10.CS1 maint: 제목으로 보관된 복사본(링크)
  2. ^ Gunde-Cimerman N, Ramos J, Plemenitas A (November 2009). "Halotolerant and halophilic fungi". Mycological Research. 113 (Pt 11): 1231–41. doi:10.1016/j.mycres.2009.09.002. PMID 19747974.
  3. ^ Jump up to: a b c Kogej T, Stein M, Volkmann M, Gorbushina AA, Galinski EA, Gunde-Cimerman N (December 2007). "Osmotic adaptation of the halophilic fungus Hortaea werneckii: role of osmolytes and melanization". Microbiology. 153 (Pt 12): 4261–73. doi:10.1099/mic.0.2007/010751-0. PMID 18048939.
  4. ^ Jump up to: a b c Gostinčar C, Lenassi M, Gunde-Cimerman N, Plemenitaš A (2011). "Fungal adaptation to extremely high salt concentrations". Advances in Applied Microbiology. 77: 71–96. doi:10.1016/B978-0-12-387044-5.00003-0. ISBN 9780123870445. PMID 22050822.
  5. ^ Turk M, Plemenitas A (November 2002). "The HOG pathway in the halophilic black yeast Hortaea werneckii: isolation of the HOG1 homolog gene and activation of HwHog1p". FEMS Microbiology Letters. 216 (2): 193–9. doi:10.1111/j.1574-6968.2002.tb11435.x. PMID 12435502.
  6. ^ Lenassi M, Vaupotic T, Gunde-Cimerman N, Plemenitas A (March 2007). "The MAP kinase HwHog1 from the halophilic black yeast Hortaea werneckii: coping with stresses in solar salterns". Saline Systems. 3: 3. doi:10.1186/1746-1448-3-3. PMC 1828057. PMID 17349032.
  7. ^ Fettich M, Lenassi M, Veranič P, Gunde-Cimerman N, Plemenitaš A (May 2011). "Identification and characterization of putative osmosensors, HwSho1A and HwSho1B, from the extremely halotolerant black yeast Hortaea werneckii". Fungal Genetics and Biology. 48 (5): 475–84. doi:10.1016/j.fgb.2011.01.011. PMID 21281727.
  8. ^ Turk M, Méjanelle L, Sentjurc M, Grimalt JO, Gunde-Cimerman N, Plemenitas A (February 2004). "Salt-induced changes in lipid composition and membrane fluidity of halophilic yeast-like melanized fungi". Extremophiles. 8 (1): 53–61. doi:10.1007/s00792-003-0360-5. PMID 15064990. S2CID 20139110.
  9. ^ Gostincar C, Turk M, Plemenitas A, Gunde-Cimerman N (March 2009). "The expressions of Delta 9-, Delta 12-desaturases and an elongase by the extremely halotolerant black yeast Hortaea werneckii are salt dependent". FEMS Yeast Research. 9 (2): 247–56. doi:10.1111/j.1567-1364.2009.00481.x. PMID 19220869.
  10. ^ Reid BJ (July 1998). "Exophiala werneckii causing tinea nigra in Scotland". The British Journal of Dermatology. 139 (1): 157–8. doi:10.1046/j.1365-2133.1998.02340.x. PMID 9764175. S2CID 70450832.
  11. ^ Jump up to: a b Lenassi M, Gostinčar C, Jackman S, Turk M, Sadowski I, Nislow C, Jones S, Birol I, Cimerman NG, Plemenitaš A (2013). "Whole genome duplication and enrichment of metal cation transporters revealed by de novo genome sequencing of extremely halotolerant black yeast Hortaea werneckii". PLOS ONE. 8 (8): e71328. doi:10.1371/journal.pone.0071328. PMC 3744574. PMID 23977017.
  12. ^ Jump up to: a b Sinha S, Flibotte S, Neira M, Formby S, Plemenitaš A, Cimerman NG, Lenassi M, Gostinčar C, Stajich JE, Nislow C (July 2017). "Hortaea werneckii: Combining an Improved Genome with Gene Expression and Chromatin Structure". G3. 7 (7): 2015–2022. doi:10.1534/g3.117.040691. PMC 5499112. PMID 28500048.
  13. ^ Dujon B (August 2015). "Basic principles of yeast genomics, a personal recollection". FEMS Yeast Research. 15 (5): fov047. doi:10.1093/femsyr/fov047. PMID 26071597.
  14. ^ Jump up to: a b Gostinčar C, Stajich JE, Zupančič J, Zalar P, Gunde-Cimerman N (May 2018). "Genomic evidence for intraspecific hybridization in a clonal and extremely halotolerant yeast". BMC Genomics. 19 (1): 364. doi:10.1186/s12864-018-4751-5. PMC 5952469. PMID 29764372.